遗传单基因性状的遗传分析及群体遗传平衡的检测.pptVIP

PTC尝味能力的检测 目的：检测PTC尝味能力在待测人群中的分布是否平衡。 方法：计算一个平衡人群的3种基因型人数，将待测人群与其比较。 两种人群的差异原因 偶然因素 必然因素 不平衡 平衡 根据原理，设计下表 基因型个体数 TT Tt tt 实际观察值(O) 预期理论值(E) X2=∑(O-E) 2/E 具体步骤 ?建立假设：待测群体平衡。 确定检验水准(α)：接受或拒绝假设的标准，α=0.05。 完善表格：填入实际观察值→计算预期理论值 基因型个体数 TT Tt tt 实际观察值(O) 预期理论值(E) p2×N 2pq ×N q2×N X2=∑(O-E) 2/E back Go 计算X2值： Go 确定P值： Go 推出结论: * * 预期理论值计算方法 计算基因频率p，q： p=fTT+1/2fTt q=ftt+1/2fTt 计算理论基因型频率： TT基因型频率：p2，Tt基因型频率：2pq Tt基因型频率：q2 计算预期理论值（E）： 预期理论值= 理论基因型频率×总人数N ↑ * * X2=∑ ↑ (O-E )2 E 计算X2值 * * 确定P值 含义：两个群体3种基因型的差异由偶然因素所致的概率； P值推算方法：根据计算的X2值查表得出； * * 自由度 如何确定自由度？ X2界值表 * * 统计学上的常用术语，指变量能自由取值的个数。 如一个样本有4个数据(n=4)，受到平均数等于5的条件限制，那么在自由确定了3个数据4、2、5后，最后一个数只能是9。所以自由度等于3。 任何统计量的自由度=n-限制条件的个数 自由度 * * 基因型个体数 TT Tt tt 实际观察值(O) 预期理论值(E) 如何确定表格的自由度？ 统计学意义的自由度= 观察的指标数-1=3-1=2 遗传学角度的自由度=统计学意义的自由度-1 =2-1=1 进一步校正 概率 (p) 0.95 0.90 0.80 0.70 0.50 0.30 0.20 0.10 0.05 0.01 0.001 1 0.004 0.02 0.06 0.15 0.46 1.07 1.64 2.71 3.84 6.64 10.83 2 0.10 0.21 0.45 0.71 1.39 2.41 3.22 4.60 5.99 9.21 13.82 3 0.35 0.58 1.01 1.42 2.37 3.66 4.64 6.25 7.82 11.34 16.27 4 0.71 1.06 1.65 2.20 3.36 4.88 5.99 7.78 9.49 13.28 18.47 5 1.14 1.61 2.34 3.00 4.35 6.06 7.29 9.24 11.07 15.09 20.52 6 1.63 2.20 3.07 3.83 5.35 7.23 8.56 10.64 12.59 16.81 22.46 7 2.17 2.83 3.82 4.67 6.35 8.38 9.80 12.02 14.07 18.48 24.32 8 2.73 3.49 4.59 5.53 7.34 9.52 11.03 13.36 15.51 20.09 26.12 9 3.32 4.17 5.38 6.39 8.34 10.66 12.24 14.68 16.92 21.67 27.88 10 3.94 4.86 6.18 7.27 9.34 11.78 13.44 15.99 18.31 23.21 29.59 自由度 差异不显著 差异显著 X2界值表 ↑ * * ①接受假设： 当p＞α时，即所检测的两个群体3种基因型频率之间的差异是由偶然因素造成的可能性(p)＞0.05，二者之间的差异不是本质差异，可忽略，假设成立。 推出结论 * * ②拒绝假设： 当pα时，拒绝假设。 即所检测的两个群体3种基因型频率之间的差异是由偶然因素造成的可能性(p)＜0.05，则由必然因素导致的可能性大，故二者之间的差异是本质差异，不可忽略，故拒绝假设。 ↑ ABO血型分布的检测 目的：检测ABO血型在待测人群中的分布是否平衡。 方法：计算一个理论的平衡人群的4种血型人数。用X2检验的比较两种人群的差异。 根据原理，设计下表 血型个体数 A B O AB 实际观察值(O) 预期理论值(E) (p2 + 2pr) ×N (q2 + 2qr) ×N r2 ×N 2pq ×N X2=∑(O-E) 2/E (p+q+r)2=1 p2 + q2 + r2 + 2pr+ 2qr+2pq=1 ↑ ↑ ↑ ↑ ↑ ↑ IA IA IB IB ii IAi IBi IAIB 具体步骤 提出假设