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液质学习资料课件
什么是质谱仪?;主要组成部分:
1.进样部分
2.离子源
3.质量过滤器(分析器)
4.离子检测器
;; 进样部分; C: MALDI 激光解吸附离子源 Matrix-Assisted laser Desorption/Ionization;常用基质;常用基质结构; MALDI的优缺点;Sample submission In solution, as concentrated as possible, volume 10-20 ul Minimum Concentration 10 pmol/microliter Use 200ul PCR-style eppendorf tubes ;D: ESI离子源Electrospray Ionization;NANO-ESI喷雾照片;ESI特点;电荷数和质量数的计算;ESI优缺点; 质量分析器(过滤器);D、分辨率 质谱分辨不同质荷比离子的能力
分辨率R=M/ΔΜ a
=M?/(M?- M?) b
a 公式定义为单峰的质荷比与其半峰宽之比
b公式定义为相邻的相交10%的两个峰M? M?
按a 式计算的分辨率约为b式计算的两倍。;不同分辨率谱图效果; 离子阱质量分析器;质量分析器的串联;空间串联质谱仪;时间串联质谱仪;几种串联质谱优缺点对比;第五章、质谱在生物学中的应用;三、肽序列标签技术;四、O标记从头测序技术;五、磷酸化蛋白质的鉴定;B、串联质谱进行母离子、中性丢失 扫描,分析含HPO3的肽段产生的特征离子,直接从混合肽段中找出磷酸化肽段。;C、PRD-MALDI-MS用源后衰变技术寻找质量数少80Da或98Da的肽段来判断磷酸肽。;D、用IMAC技术分离/富集磷酸肽对比前后质谱变化寻找磷酸肽。 IMAC immobilized metal affinity固相金属亲和色谱。IMAC 对磷酸肽有高选择结合能力,富集后用高PH或磷酸盐洗脱后测质谱。;E、磷酸化位点的确定;F、磷酸化定量分析;2、同位素亲和标记法;六、糖基化蛋白的鉴定;B、糖基化位点的确定;C、用凝集素直接提取含糖肽段,再结合质谱技术分析;七、质谱在蛋白质组学中的应用;优缺点;2DLC-MS的基本原理;Why 2D LC/MS?;Then why SCX/RP/MS?;;;;on-line 2D-LC;off-line SCX with fraction collection;The secret behind sensitivityReducing column dimensions;Tandem MS;Data dependent MS/MS;+;碎片离子的命名; Residue name (A-Z) monoisotopic mass average mass
A 71.03711 71.0788
B 114.53493 114.59625
C 103.00919 103.1388
D 115.02694 115.0886
E 129.04259 129.1155
F 147.06841 147.1766
G 57.02146 57.0520
H 137.05891 137.1412
I 113.08406 113.1595
J 0.0 0.0
K 128.09496 128.1742
L 113.08406 113.1595
M 131.04049 131.1925
N 114.04293 114.1039
O 0.0 0.0
P 97.05276 97.1167
Q 128.05858 128.1308
R 156.10111 156.1876
S 87.03203 87.0782
T 101.04768 101.1051
U 150.95364 150.034
V 99.06841 99.1326
W 186.07931 186.2133
X 111.0 111.0
Y 163.06333 163.1760
Z 128.55059 128.62315;CID条件下tryptic peptides裂解规律——mobile proton model;ESI-M
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