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《生物信息学》复习要点
题型:名词解释、选择、判断、计算、特别说明:关键要明白每个名词的意义,知道是什么意思。
生物信息学引论 生物信息学;
生物信息指哪些?;
大规模测序的基本策略功能基因组学;生物信息学的应用有哪些?什么事件大大促进了生物信息学的发展?(HGP);生物信息学中最重要的贡献是什么(序列比对算法)?基因组测序完成的主要物种(如人,水稻,大肠杆菌,酵母,拟南芥,果蝇等);基因组人类基因组计划的主要任务第二章 生物信息学的生物学基础 碱性氨基酸和酸性氨基酸的种类;蛋白质一级结构、二级结构、三级结构的概念;核苷酸序列中N表示什么?真核生物基因的一般结构? 转录本;启动子(promoter);EST;cDNA;内含子;外显子;UTR;TATA-box;ORF;终止密码子; poly(A)加尾信号;TSS;中心法则;?第三章 生物数据库资源及其应用 三大核酸数据库?数据的PubMED检索规则;核酸/蛋白质记录的检索规则;UniGene;创建最早使用最广泛的蛋白质数据库是什么?(SWISSPROT和PIR);?第四章 序列分析相似性;一致性;同源性;序列比较的矩阵作图法;最长公共子序列;空位罚分;打分矩阵;;BLAST比对结果中图形颜色的意义以及score和E-value的含义;FASTA格式;BLAST含义;nr数据库;EST数据库;检索某个基因序列的方法;?第五章 系统发生分析 系统发生;系统发生树;趋同进化;无根树;有根树;直系同源与旁系同源;系统发生树的构建方法种类;非加权组平均法原理;最大简约法原理;信息位点;Bootstrap非加权组平均法
?第章 电子克隆技术电子克隆(in silico cloning);判断1个基因5端是否完整的方法;内含子的规则(GU..AG)
进一步说明:
要了解BLAST的一般步骤和意义;
了解序列分析的基本内容和意义;
上机操作和作业中涉及的网站和程序名称等(选择,不需要记得网址)
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