第20讲REHO修改.ppt

点击t-contrasts按钮 然后点击Define new contrast按钮 输入对比矩阵名称如HC-PA 输入对比矩阵，1 -1表示第一组 减去第二组 点击OK 点击Done 按照红色圈内的参数进行设置 打开xjview界面，load上一步生 成的T图设置参数后可得到有差 异的脑区 result Figure，Correlation of E score and ReHo value (P0.05, corrected by Alphasim, a combined threshold of P0.005, and a minimum cluster size of 46 voxels) in the MPFC (12, 45, 6) (r=-0.40, p0.0001) Regional Homogeneity (ReHo) Approach for Rest functional MRI ReHo Approach The Relationship between ReHo and Personality Lu qing Wei ReHo Approach 一、原理和计算方法 ReHo的基本假设：(1) 一个活动的功能区内部不同体素的时间序列有一定的相似性； (2) 这种相似性在不同的任务状态下会发生改变 ReHo的计算原理：采用肯德尔协和系数 Kendall coefficient of concordance (KCC)来测量 W 为该K个体素的时间序列的Kendall系数，代表着某一个体素的ReHo值，范围0-1。 Kendall 协和系数度量了多个体素时间序列的相似性，其值越大表示这些时间序列越相似。 第i个时间点的秩和 的平均值 计算方法 预处理 计算ReHo值 预处理过程 一、数据格式转换 DICOM to NIFTI 二、去除时间点 原因：机器的稳定，被试的适应等 三、Slicing timing 时间对齐 原因：全脑按层扫描，为了矫正层与层之间时间点的不对应 Slice Number: 扫描层数 Slice Order:扫描方式，隔层扫，逐层扫 Reference Slice: 参考层 处理完之后，出现以a开头的img，hdr 文件 三、Realign 头动矫正 原因：告诉被试尽量不动，但实际测量当中不可能做到不动，头动对数据有影响，需要矫正 曲线图translation示头动平移，rotation表示头动旋转。 translational and rotational 参数 超过 1.5 mm or 1.5°。产生raf开头的hdr、img文件，.ps文件， rp_af*.txt 剔除被试的标准 四、Normalize 配准 原因：个体差异，需要用统一的空间坐标系标准化 Normalize 配准完之后需要检查配准的效果 五、Smooth 平滑 提升配准的效果，提高信噪比 计算ReHo时先不进行平滑 Detrend 去基线漂移 原因：数据采集过程中，很多Volex的信号有上升或下降的趋势，对结果有影响 七、滤波0.01-0.08HZ 原因：静息状态下，低频信号有意义 ReHo The Relationship between ReHo and Personality ReHo值与人格量表分数算相关 选用的方法：SPM8 提供的Multiple regression 原因：排除年龄，性别，灰质体积对结果的影响 怎样得到灰质体积？ 方法：VBM 统计检验 选用的方法：SPM8 提供的检验工具 步骤：  步骤一：Sepcify 2nd-level 点击Two-sample t-test Directory:选择路径 Group1、2 scans:选择两组 人的Reho 文件  Explict Mask:选择全脑或者灰质模板 点击run运行  步骤二：Estimate 选择上一步生成的SPM.mat文件 点击run运行 步骤三：Results