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串联重复序列的物种差异及其生物功能
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高 焕 ,孔 杰
( 中国水产科学研究院黄海水产研究所 农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室,山东青岛 ;
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中国科学院海洋研究所,山东青岛 ; 中国科学院研究生院,北京 )
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摘要 串联重复序列是指! ( %% 个碱基左右的核心重复单位,以头尾相串联的方式重复多次所组成的重
复序列。它广泛存在于真核生物和一些原核生物的基因组中,并表现出种属、碱基组成等的特异性。在基因组
整体水平上,各种优势的重复序列类型不同。即使在同一重复序列类型内部,不同重复拷贝类别 (如 、
)* )+
等)在基因组中的存在也表现出很大的差异。同时,这些重复序列类型和各重复拷贝类别在同一物种的不同染
色体间,以及基因的编码区和非编码区间也表现种属和碱基组成差异。这些差异显示了重复序列起源和进化的
复杂性,可能涉及到多种机制和因素,并与生物功能密切相关。另外,由于重复序列分析软件和统计标准还存
在算法、重复长度、完美性等问题,需要进一步探讨。此外,串联重复序列的自身进化关系、全基因组水平上
的进化地位、在基因组中的生物功能、重复序列数据库建立和应用研究等,将是今后研究的主要课题。
关键词:串联重复序列;微卫星;小卫星;基因组;起源与进化
中图分类号: ; ; 文献标识码: 文章编号: ( )
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