DNA分离技术.ppt

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第一部分:DNA提取方法简介 第二部分:DNA提取常见问题、      原因分析及其对策 内容 第三部分:RNA提取方法简介 第四部分:RNA提取及其RT-PCR常见 问题、原因分析及其对策 第三部分:RNA提取方法简介 RNA提取的通用方法  异硫氰酸胍/苯酚法 原理: 细胞在变性剂异硫氰酸胍的作用下被裂解,同时核蛋白体上的蛋白变性,核酸释放; 释放出来的DNA和RNA由于在特定pH下溶解度的不同而分别位于整个体系中的中间相和水相,从而得以分离;在酸性至中性条件下,DNA和蛋白质一起变性通过离心去除,RNA仍留在上清液中,最后用异丙醇沉淀。 有机溶剂抽提,沉淀,得到纯净RNA。 RNA提取的通用方法  异硫氰酸胍/苯酚法 步骤: 材料准备:尽量新鲜。 裂解变性:异硫氰酸胍(亚硫氢胍,巯基乙醇,N-月桂肌氨酸等)。 使细胞及核蛋白复合物变性,释放RNA,有效抑制核酸酶。 纯化分离:苯酚,氯仿,异戊醇。苯酚/氯仿可抽提去除杂物。 洗涤:70%乙醇。 沉淀:异丙醇、无水乙醇。 乙酸钠(pH4.0):维持变性的细胞裂解液的pH值,沉淀RNA。 此外还常用氯化锂选择沉淀RNA。 RNA提取的通用方法 RNA提取实例------大豆总RNA的提取 1) 配制提取液 异硫氰酸胍(4mol/l) 4ml 苯酚 3ml 醋酸钠(2mol/l PH4.8) 0.3ml 氯仿 0.6ml PVP 0.04g 2) 将研钵放在-80℃冰箱中预冷,取1.2g花生豆授粉后30天的未成熟种子放入研钵中,加入液氮,迅速将花生豆研磨成粉末状,转移至提取液中,混匀,冰浴30min。 3) 4℃,8000rpm,离心13min。 4) 取上清,加入等体积的苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),4℃,12000rpm,离心5min. RNA提取的通用方法 5) 取上清,加入0.5体积的3mol/l KAc(PH4.8),混匀,冰浴30min, 4℃,13000rpm,离心15min. 6) 取上清,加入2倍体积无水乙醇,-20℃放置1h, 4℃,8000rpm,离心13min。 7) 弃上清,在沉淀中加入1ml 4mol/LLicl,使溶解,移入1.5mlEppendorf管中,冰浴2h, 4℃,13000rpm, 离心15min. 8) 弃上清,在沉淀中加入400uldH2O(经DEPC处理),再加入400ul氯仿,混匀,4℃,13000rpm, 离心6min. 9) 取上清,加入0.1体积的3mol/l NaAc(PH5.0),2倍体积无水乙醇,-20℃放置,30min,4℃,13000rpm,离心13min. 10) 弃上清,将沉淀RNA用70%乙醇洗涤2次,室温下干燥(70%乙醇用DEPC处理水配制) 11) 加入100ul dH2O(经DEPC处理)溶解,-20℃保存。 RNA提取的通用方法 影响RNA提取的因素 材料: 新鲜,切忌使用反复冻融的材料 如若材料来源困难,且实验需要一定的时间间隔。可以先将材料贮存在TRIzol或样品贮存液中,于-70℃或-20℃保存 如要多次提取,请分成多份保存 液氮长期保存,-70℃短期保存 影响RNA提取的因素 影响RNA提取的因素 样品破碎及裂解: 根据不同材料选择不同的处理方法: 培养细胞:通常可直接加裂解液裂解 酵母和细菌:一般TRIzol可直接裂解,对于一些特殊的材料可先用酶或者机械方法破壁 动植物组织:先液氮研磨和匀浆,后加裂解液裂解。期间动作快速,样品保持冷冻 样品量适当,保证充分裂解 为减少DNA污染,可适当加大裂解液的用量 影响RNA提取的因素 纯化: 在使用氯仿抽提纯化时,一定要充分混匀,且动作快速; 经典的纯化方法,如 LiCl 沉淀等,虽然经济,但操作时间长,易造成 RNA 降解; 柱离心式纯化方法:抽提速度快,能有效去除影响 RNA 后续酶反应的杂质,是目前较为理想的选择。 影响RNA提取的因素 第一部分:DNA提取方法简介 第二部分:DNA提取常见问题、      原因分析及其对策 内容 第三部分:RNA提取方法简介 第四部分:RNA提取及其RT

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