普通小麦果聚糖-6果糖基转移酶6-.PDFVIP

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2017-06-07 发布于江苏
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普通小麦果聚糖-6果糖基转移酶6-

普通小麦果聚糖-6果糖基转移酶6- SFT 的生物信息学分析小组:G11 汇报人:董艳小组成员:白娜王翠红董艳卢家玲提纲 1 研究背景及意义 2 基因序列分析 3 蛋白质序列分析 4 蛋白质功能预测研究背景及意义 小麦在中国是主要的谷物和粮食作物,约有 2400 万公顷,平均产量4.7吨/ 公顷, 总产量约 11亿吨. 果聚糖是温带和冷寒带地区碳水化合物的主要储存形式,主要存在禾本科作物小麦、大麦、梯牧草中.果聚糖有多种生物学功能. 果聚糖代谢的生理作用 作为储藏性碳水化合物 调节光合组织中蔗糖库的大小 适应低温光合作用 对缺氧的适应性食用含果聚糖的食物,可以选择性 适应低温、增强抗旱性地促进双歧杆菌的生长,减少与肿 有效减少和降低结肠癌,心瘤发生有关的物质产生. 血管疾病和骨质疏松症等发病几率. 6-SFT 的催化机制 蔗糖- 果聚糖 -6- 果糖基转移酶（Sucrose: fructan 6- fructosyltransferase, 6-SFT）,是果聚糖合成过程中的关键调节酶.在进化上起源于液泡转化酶,属糖基水解酶32 家族（glycosyl hydrolase family32,GH32),N 末端为 β-螺旋模型, 由五个刀片状结构组成,C末端有一个 β- 夹心模型. 本实验拟研究6-SFT 的结构、功能,从而为克隆6-SFT 基因奠定基础. 6-SFT 已公布的信息 F1 阅读框 plotorf 对开放阅读框的预测最有可能是正的阅读方式 -coderet提取CDS序列  fj228688_cds_1 atggggtcacacggcaagccaccgctaccgtacgcgtacaagccactgccctccggcgccgccgtggacgccgacggtgagcggaccggctggacg aggtggcgcgtgtgcgccaccgtgctgacggcctcggccatggtggtggtggtggtcggcgccacgctcctggcagggttcagggtggaccaggccgt cgacgaggaggccgcggccgggttcccgtggagcaacgagatgctgcagtggcagcgcagtggctac