利用文本挖掘进行药物重新定位的步骤与工具.pdf

· 6 · 中华医学图书情报杂志2017年3月 第26卷第3期 ChinJMedLibrInfSci，Vo1．26No．3 March，2017 DOI：10．3969／j．issn．1671—3982．2017．03．002 ·专题 ：生物医学文本挖掘 · 利用文本挖掘进行药物重新定位的步骤与工具 高 曼。崔 雷 [摘要]文本挖掘技术为药物重新定位提供 了新思路，不断出现的新数据库以及相应工具，为利用文本挖掘技术进行药物重新 定位提供了越来越多便利。介绍了一些使用文本挖掘方法进行药物重新定位研究的方法和工具及成功应用这些方法和工具 的范例，以便为对此领域感兴趣的研究人 员提供参考。 [关键词]药物重新定位；文本挖掘 ；信息分析工具 [中图分类号]R918：TP311．13 [文献标志码]A [文章编号]1671—3982(2017)03—0006—04 Stepsandtoolsfordrugrepositioningbytextmining GA0 M an．CUILei (ChinaMedicalUniversityMedicalInformaticsSchool，Shenyang110122，LiaoningProvince，China) Correspondingauthor：CUILei [Abstract]Textminingprovidesanewapproachfordrugrepositioning，andtheemergingdatabasesandtheircor- respondingtoolsprovidemoreandmoreconvenienceofrdurgrepositioningbytextmining．Themethodsandtools ofrstudyingdurgrepositioningbytextminingandtheirsuccessfulapplicationexampleswerethusdescribedinthis paperin ordertoprovidereferenceofrtheresearchersinterestedinthisfield． [Keywords]Durgrepositioning；Textmining；Toolofinformationanalysis 药物重新定位(DurgRepositioning)指药物新适 开发商关注的热点 。 应症的开发，即利用相关技术方法对 已有药物进行 “文本挖掘”技术为药物重新定位提供 了新思 重新筛选、组合或改造从而发现其新用途 的过 路。MartiA．Hearst将文本挖掘定义为使用计算机 程…。新药的开发需要经历多次研发试验 以及临 从不同的文字资源中自动抽取信息，发现之前不存 床试验，因此需要消耗大量人力、物力和财力。但是 在的信息 J。因此使用文本挖掘技术可以从大量 对已存在药物进行重新定位，发现其新用途可以大 文本集合中预测新的关系，发现新知识。 大减少资源消耗，避免新药可能带来的风险。因此 近年来越来越多的学者尝试用文本挖掘技术发 对药物的重新定位研究已成为当今很多研究人员和 掘不同药物作用机制，不同疾病病理机制甚至不同 药物副作用之间的相似性，以预测药物新的适应症， [基金项 目]2016年辽宁省大学生创新创业训练计划项 “利用文本挖 进行药物重新定位。本文介绍了文本挖掘在药物重 掘方法发现肺癌相关基因调控机理”(201610159)研究 新定位研究中的基本步骤和近年来利用文本挖掘技 成果之一 术进行药物重新定位常用的工具及部分成功范例。 [作者单位]中国医科大学医学信息学院，辽宁沈阳 110122 1 文本挖掘技术应用于药物重新定位的研究现状 [作者简介]高 曼(1994一)，女 ，河南周 口人 ，在读本科生，研究方 向 为医学信息学．