DNA条形码识别VI.基于微型DNA条形码.pdf

215-219 2009．04—25 应用与环境生物学报2009，1s(2l Biol=lSSN DoI：10．3724／SP．J．1145．200900215 Chin Environ 1006·687X JAppi DNA条形码识别VI．基于微型DNA条形码的 果实蝇物种鉴定木 范京安p’ 顾海丰2¨ 陈世界， 莫帮辉，温演庆-何万兴· 刘伟· 曾晓茂z¨‘ (1四川出人境检验检疫局；2中国科学院成都生物研究所；3中国科学院成都计算机应用研究所成都610041) 摘要 选用双翅目实蝇科12属36种55个样本为材料，将其DNA条形码(mtDNACOI基因648bp)与微型DNA条形码 (mtDNACOI基因50～200bp)数据进行比较分析，探讨微型DNA条形码对果实蝇物种鉴定的可行性．采用虚拟实验 (Silicoanalysis)，将BOLD数据库中49个样本的序列分别拆成648bp、160bp、50bp三个片段，通过构建NJ树。并进行 遗传距离分析，得出每个片段鉴定物种的准确性依次为100％、94％、84％．同时做了实体实验(Empiricaltest)，得到了 果实蝇属6个物种的COI序列，将其与虚拟实验中的49个样本序列合并，以DNA．barcode指定序列5’端160bp序列为分 析基础，通过遗传距离分析。得出其鉴定物种的准确性为94％，验证了虚拟实验结果．即微型DNA条形码(Minimalist． barcode)鉴定果实蝇物种的准确性与DNA条形码基本一致，均可作为果实蝇物种鉴定的有效依据．图2表l参29附l 关键词实蝇科；COl基因；DNA条形码；微型DNA条形码；物种鉴定 CLC$41-33：Q523 Identi6cationof36KindsofFruitFliesBasedon Species FAN Jing’anl”，GUHaifen92”，CHENShijiel，MOBanghui3，、～匿NYanqing。，HEWanxing‘， L11JW萌1ZENGXiaoma02”’ (SichuanEntry—exitInspectionandQuarantineBureau，Chengdu610041，China) Institute (ZChengduofBiology,ChineseAcademyofSciences，Chengdu610041，China) 610041，China) AbstractThedatafromminimalistDNAbarcodeandDNAbarcodewere to iftheminimalistDNAbarcode comparedtestify wasavailablefor identification．We 49 fromBOLDinto3sized firstdidsilico COI species experiment．dividedsequences segments(648bp，50 the ofthese outa bp，160 bp)，calculatedaccuracy segmentsbycarrying and the distance．Theresultsindicatedthatthe648barcode