大麦遗传多样性及SSR标记及大麦条纹病抗性关联分析.PDF

Online system: 农 业 生 物 技 术 学 报 Journal of Agricultural Biotechnology 2015, 23(2): 193~202 DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2015.02.006 大麦遗传多样性及SSR 标记与大麦条纹病抗性关联分析 1，2 1，2 1，2 1，3 1，2 1，2 1，2* 司二静 赖勇 孟亚雄 李葆春 马小乐 尚勋武 王化俊 1甘肃省干旱生境作物学重点实验室/甘肃省作物遗传改良与创新重点实验室，兰州730070 ；2 甘肃农业大学农学院，兰州730070 ；3 甘肃 农业大学生命科学技术学院，兰州730070 *通讯作者，whuaj un@ 要 为了解大麦(Hordeum vulgare)亲本材料遗传多样性，筛选与大麦条纹病性状相关联的SSR 标记， 利用100 对多态性SSR 引物对86 个大麦品种进行分析，共检测出269 个等位变异，平均每对引物为2.69 个，变幅为2~5 ；等位 因频率为0.012~0.988 ；Shannon 指数为0.064~1.385 ；遗传相似系数为0.547~0.955 ； 多态性信息含量(polymorphic information content, PIC)为0.023~0.737 ，平均为0.357 。群体遗传结构分析 表明，供试大麦亲本材料可分为5 个亚群。根据一般线性模型(general linear model, GLM) 分析，共5 个标 记与大麦条纹病抗性性状关联，解释率在6.20%~ 11.15%之间，其中TACMD 和MGB3 17达到极显著水平 (P ＜0.01)，解释率分别为9.24%和9.45% ；根据混合线性模型(mixed linear model, MLM) 分析，发现3 个与 大麦条纹病抗性相关的标记，解释率在4.57%~ 17.63%之间，标记HVM54 达到极显著水平(P ＜0.01)，解释 率为17.63% 。本研究为大麦条纹病抗病育种提供了一定理论依据。 关键词 大麦，遗传多样性，SSR，群体结构，大麦条纹病抗性，关联分析 Genetic Diversity and Association Analysis of SSR Markers with Leaf Stripe Resistance in Barley(Hordeum vulgare) SI Er- Jing1, 2 LAI Yong1, 2 MENG Ya-Xiong1, 2 LI Bao- Chun1, 3 MA Xiao- Le1, 2 SHANG Xun- Wu1, 2 WANG Hua-Jun1, 2* 1 Gansu Provincial Key Laboratory of Aridland Crop Science/Gansu Key Laboratory of Crop Important Germplasm Enhancement, Lanzhou 730070, China; 2 College of Agronomy, Gansu Agricultural University, Lanzhou 730070, China; 3 College of Life Science and Technology, Gansu Agricultural University, Lanzhou 730070, China * Corresponding author, whuajun@ Abstract To understand the genetic diversity of barley( Hordeum vulgare) and identify SSR markers associated with resistance to barley leaf stripe, 100 pairs of SSR markers were use