组蛋白去乙酰化酶抑制剂影响的代谢相关基因的组学筛查和验.PDF

Hereditas (Beijing) 2015 年9 月, 37(9): 918 ―925 研究报告 组蛋白去乙酰化酶抑制剂影响的代谢相关基因的组学 筛查及验证 曹继红 1 ，廖尉廷 2 ，沃琤 1 ，徐国荣 1 ，徐焕新 1 ，李平龙 1 ，陶冶 1 ，王鹏 1 ， 林加日 2 ，邓连瑞 3 1. 九江市第三人民医院，九江 332000; 2. 南昌大学转化医学研究院，南昌 330000; 3. 南昌大学第四附属医院，南昌 330000 摘要:组蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylases, HDACs)催化组蛋白去乙酰化，与细胞增殖、分化及凋亡等诸 多过程密切相关。HDAC 抑制剂(HADC inhibitors, HADCIs)具有潜在的抗肿瘤作用，是近年药物筛查的热点 之一。近期研究提示 HDAC2 可通过影响细胞代谢过程发挥抗肿瘤作用，但各类 HDACIs 调控代谢过程的机 制尚待研究。本研究以肝细胞系(HepG2)为研究对象，整合比较了两种HDACIs(TSA 和SAHA) 的表达谱数据。 在TSA 处理组中，筛查到380 个差异表达基因(DEGs)及 35 个DEGs 富集的KEGG 通路；SAHA 处理组的表 达分析印证了大多数DEGs( 177/380)和富集通路(23/35) 。比较分析发现，在这两类HDACIs 共同影响的通路中， 近一半通路(9/23) 与代谢有关；近 1/3 共享DEGs(66/177)参与代谢过程。通过HDAC2 siRNA 细胞实验证实了 TSA 和 SAHA 对代谢基因的影响。本研究结果显示 HDACIs 在治疗肿瘤等代谢性疾病方面具有潜在的应用 价值。 关键词:组蛋白去乙酰化酶抑制剂；代谢；基因表达 Transcriptome screening and verification of genes related to metabol- ism affected by histone deacetylase inhibitors 1 2 1 1 1 1 Jihong Cao , Weiting Liao , Cheng Wo , Guorong Xu , Huanxin Xu , Pinglong Li , 1 1 2 3 Ye Tao , Peng Wang , Jiari Lin , Lianrui Deng 1. Jiujiang Third Peoples Hospital, Jiujiang 332000, China; 2. Institute for Translational Medicine, Nanchang University, Nanchang 330000, China; 3. The Second Affiliated Hospital, Nanchang University, Nanchang 330000, China Abstract: Histone deacetylases (HDACs) are responsible for catalyzing the deacetylation of histones, 收稿日期: 2015−05−12 ; 修回日期: 2015−08−09 基金项目: 江西省自然科学基金项目(编号：20122BAB215020)和江西省卫生厅科技计划项目(编号资助 作者简介: 曹继红，副主任医师，专业方向：肝脏疾病。E-mail: caojihong1234@163.com 廖尉廷，本科在读。E-mail: liaoweitingl@163.com 曹继红、廖尉廷为并列第一作者。 通讯作者: 邓连瑞，讲师，研究方向：分子诊断。E-mail: lrdeng@163.com DOI: 10.16288/j.yczz.15-128 网络出版时间: 2015-8-12 9:06:33 URL: /kcms/detail/11.1913.R.20150812