如何在windows中创建R程序包.pdf

如何在windows 中创建R 程序包? 张金龙jinlongzhang01@2010 年5 月9 日修订 在Windows 环境下如何编写R 程序包，即生成供linux 环境编译运行的tar.gz 文件， 也生成供windows 下使用的.zip文件呢？其实并不复杂，只要下载一些工具软件，按照 相应的步骤填写相应的“表格”，继而运行一些简单的指令，就可以生成R 的程序包了。 编写R 程序包通常包括以下几步： （1） 工具软件Rtools 的安装和备选软件的安装。 （2） r脚本的准备，也就是用来生成程序包的函数脚本。 （3）利用R 中自带的package.skeleton()函数，生成制作包所需要的Description 文件和帮助文件帮助文件.rd。 （4） 编辑该函数生成的Description 文件和帮助文件.rd （5） 在windows cmd 的命令行中输入相应的命令，生成zip文件或者.tar.gz 下面我们来一起建立只有一个函数的R 程序包，来详细说明： 一 工具软件安装和配置 制作r 包的工具软件包括Rtools，HTML 编译器(R2.10后不需要HTML 编译器)，MikTeX 或 Ctex （备选软件不一定要安装）： 1 工具软件安装 （1）Rtools （制作R 包的主要工具） Rtools是在windows 下制作R 包的一系列工具，其中包括 1） CYGWIN 在Windows 下模拟UNIX 环境 2） MinGW 编译器，可用来编译C 和Fortran 语言。 3） Perl 下载地址： /Rtools/ （2） 微软HTML 编译器(备选): 用来从源文件生成HTML 格式的帮助文件(2.10 以后的版本则不需要) 下载地址：/fwlink/?LinkId=14188 （3） MikTeX 或CteX （备选） 用来生成PDF 格式的帮助文件 下载地址：/ / 分别按照要求安装好。 2 设置文件启动路径：设置启动路径的目的是在cmd 命令行可以直接调用Rtools。右键 点击： 我的电脑属性高级环境变量系统变量 PATH 一项，点击“编辑”，检查是否具有以下路 径，如果没有，需要手工添加： c:\Rtools\bin;c:\Rtools\perl\bin;c:\Rtools\MinGW\bin; C:\CTEX\MiKTeX\miktex\bin;C:\CTEX\CTeX\ctex\bin;C:\CTEX\CTeX\cct\ bin;C:\CTEX\CTeX\ty\bin;C:\CTEX\Ghostscript\gs8.64\bin;C:\CTEX\GS view\gsview;C:\CTEX\WinEdt;C:\Program Files\R\R-2.9.0\bin\; 二 R 脚本的准备 假如现在我们已经有了一个编好的R 函数linmod，用来给出回归的精确结果,存成了r脚 本的格式,文件名为linmod.r 其内容如下所示，那么该如何制作R 程序包呢？ linmod- function(x, y) { qx - qr(x) coef - solve.qr(qx, y) df - nrow(x)-ncol(x) sigma2 - sum((y - x%*%coef)^2)/df vcov - sigma2 * chol2inv(qx$qr) colnames(vcov) - rownames(vcov) - colnames(x) list(coefficients = coef, vcov = vcov, sigma = sqrt(sigma2), df = df) } 三 R 包框架的准备 1 生成准备文件 登陆R ：开始所有程序RR.2.9.0 (1)清除内存中的对象： rm(list=ls()) (2)设定工作目录，这里设定为 c:/pa setwd(c:/pa) (3)将制作包的源文件 linmod.r拷贝到c:/pa/文件夹下, 之后输入：(注R 工作界面最好是英文，中文有时候会出错) package.skeleton(name=linmod,code_files=c:/pa/linmod.r) 此时，R 控制台中显示 Creating directories ... Creating DESCRIPTION ... Creating Read-and-delete-me ... Saving functions and data ... Making help files ... Done. Further