细菌核酸适配体筛选研究进展.PDF

２０１６年４月 Ｖｏｌ．３４ Ｎｏ．４ Ａｐｒｉｌ ２０１６ ＣｈｉｎｅｓｅＪｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙ ３８９～３９６ 多尺度靶标的核酸适配体筛选研究进展专栏 ·专论与综述 ＤＯＩ：１０．３７２４／ ＳＰ．Ｊ．１１２３．２０１５．１２０２１ 细菌的核酸适配体筛选的研究进展 １，２ ２ １∗ 陈尔凝 ，　 赵新颖 ，　 屈　 锋 （１． 北京理工大学生命学院，北京 １０００８１；２． 北京市理化分析测试中心，北京 １０００８９） 摘要：核酸适配体（ａｐｔａｍｅｒ）是通过指数富集配体系统进化技术（ＳＥＬＥＸ）筛选的能够以高亲和力和高特异性识别 靶标分子或细胞的核糖核酸（ＲＮＡ）和单链脱氧核糖核酸（ｓｓＤＮＡ）。 作为化学抗体，核酸适配体的制备和合成比抗 体的成本更低。 核酸适配体的靶标范围极其广泛，包括小分子、生物大分子、细菌和细胞等。 针对细菌靶标筛选的 适配体，目前主要应用于食品、医药和环境中的细菌检测。 细菌的核酸适配体筛选可以通过离心法将菌体⁃适配体 复合物与游离的适配体分离，并通过荧光成像、荧光光谱分析、流式细胞仪分选、ＤＮＡ捕获元件、酶联适配体分析等 方法表征适配体与靶标的相互作用。 筛选出的适配体可结合生物、化学检测方法用于细菌检测。 本文介绍了细菌 适配体的筛选和表征方法以及基于适配体的检测方法的必威体育精装版进展，分析了不同检测方法的利弊，并列出了２０１１～ ２０１５年筛选的细菌的核酸适配体。 关键词：核酸适配体；细菌；筛选；指数富集配体系统进化技术；综述 中图分类号：Ｏ６５８　 　 　 文献标识码：Ａ　 　 　 文章编号：１０００⁃８７１３（２０１６）０４⁃０３８９⁃０８ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ａｄｖａｎｃｅｓ ｏｆ ａｐｔａｍｅｒｓ ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ ｆｏｒ ｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔａｒｇｅｔｓ １，２ ２ １∗ ＣＨＥＮ Ｅｒｎｉｎｇ ，ＺＨＡＯ Ｘｉｎｙｉｎｇ ，ＱＵ Ｆｅｎｇ （１．Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆ ＬｉｆｅＳｃｉｅｎｃｅ，Ｂｅｉｊｉｎｇ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｂｅｉｊｉｎｇ １０００８１，Ｃｈｉｎａ； ２．Ｂｅｉｊｉｎｇ ＣｅｎｔｅｒｆｏｒＰｈｙｓｉｃａｌ ａｎｄ ＣｈｅｍｉｃａｌＡｎａｌｙｓｉｓ，Ｂｅｉｊｉｎｇ １０００８９，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ａｐｔａｍｅｒｓ ａｒｅＲＮＡ ｏｒｓｉｎｇａｌ ｓｔｒａｎｄｅｄＤＮＡ （ｓｓＤＮＡ），ｗｈｉｃｈａｒｅｓｅｌｅｃｔｅｄｂｙ ｓｙｓｔｅｍ⁃ ａｔｉｃ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ ｌｉｇａｎｄｓ ｂｙ ｅｘｐｏｎｅｎｔｉａｌ ｅｎｒｉｃｈｍｅｎｔ （ＳＥＬＥＸ）． Ｃｏｍｐａｒｅｄｔｏ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，ａｐｔａｍ⁃ ｅｒｓ ａｓ ｃｈｅｍｉｃａｌａｎｔｉｂｏｄｉｅｓａｒｅａｒｔｉｆｉｃｉａｌｌｙ ｓｙｎｔｈｅｓｉｚｅｄｗｉｔｈｌｏｗ ｃｏｓｔ．Ｔｈｅｙ ｃａｎｂｉｎｄａｗｉｄｅｒａｎｇｅ ｏｆ ｔａｒｇｅｔｓ，ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ｓｍａｌｌ ｍｏｌｅｃｕｌｅｓ，ｌａｒｇｅ ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｍｏｌｅｃｕｌｅｓ，ｂａｃｔｅｒｉａ ａｎｄ ｃｅｌｌｓ． Ａｐｔａｍｅｒｓ ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ｂａｃｔｅｒｉａ ｈａｖｅ ｔｈｅ ｐｏｔｅｎｔｉａｌ ｔｏ ｂｅ ｕｓｅｄ ｆｏｒ ｐａｔｈｏｇｅｎ ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ ｉｎ ｆｏｏｄ，ｍｅｄｉｃｉｎｅ ａｎｄ ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ． Ｔｏ ｓｅｌｅｃｔ ａｐｔａｍｅｒｓ ｗｉｔｈ ｈ