高等植物DNA条形码必威体育精装版研究进展和其应用.PDF

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核 农 学 报  2016,30(5):0887 ~0896 887   Journal of NuclearAgricultural Sciences 文章编号:1000⁃8551(2016)05⁃0887⁃10 高等植物 DNA条形码必威体育精装版研究进展及其应用 1 1 2 1 3 3 付  涛  王志龙  钱萍仙  李  文  袁冬明  严春风 1 2 ( 宁波城市职业技术学院,浙江 宁波  315502; 浙江万里学院生物与环境学院,浙江 宁波  315100; 3宁波市鄞州区林业技术管理服务站,浙江 宁波  315100) 摘  要:植物DNA 条形码的筛选工作主要集中于叶绿体基因上,包括位于编码区的matK、rbcL、UPA、 rpoB、rpoC1、accD、ndhJ 和 YCF5 等以及间隔区的trnH⁃psbA、trnL⁃trnF、atpF⁃atpH、trnD⁃ trnY和psbK⁃psbI 等,其中matK、rbcL 和trnH⁃psbA 研究最为成熟,可作为核心条形码序列。 由于每个基因进化速率不同以 及植物种间杂交较为频繁等诸多原因,不同类群植物的最适条形码序列有很大差别。 本文综述了DNA 条形码的必威体育精装版研究进展以及条形码技术在物种鉴定、分类学问题修订、新种隐种的发现、植物药材真伪 鉴定、食品质量控制和安全、出入境植物检验检疫等方面的应用,提出了cpDNA条形码在应用中的不足 之处以及解决措施等,并对DNA条形码未来的发展进行了展望,以期为高等植物的应用提供强有力的 分子依据。 关键词:高等植物;叶绿体基因;DNA条形码;条形码应用 DOI:1011869/ j.issn.100⁃8551201605.0887 [1]     2003年动物学家Hebert等 首次明确提出DNA 记就可能会得出错误结果。 以上因素均使植物在遗传 条形码概念,即利用1个或几个短DNA片段对地球上 进化和不同基因组遗传变异上变得更加复杂,而理想 现有的物种进行快速、准确识别和鉴定。 目前,线粒体 DNA条形码在短序列片段内对种间和种内的遗传变 基因细胞色素 C 氧化酶亚基 I (COI)已被广泛应用于 异有一定的要求。 动物的物种识别和鉴定,成为动物的通用 DNA 条形 长期以来,植物 DNA 条形码多选用叶绿体上的 码[1-4]。 但由于线粒体基因(包括 COI 基因)进化速 DNA序列片段(如 matK、rbcL、trnH⁃psbA、rpoC1、rpoB、 率慢,并不适合作为植物通用条形码的选择区域,至今 accD、yCF5 和nhdJ 等)及其不同片段组合。 近年来, 还未找到类似 COI 的植物“通用标记”,这主要因为: 不同的学者提出了不同叶绿体序列片段组合作为整个 [4] 1)同一基因在不同植物类群的进化速率不同;2)植物 陆地植物鉴定的DNA 条形码。 如 Kress 等 提出的 [5] 种类繁多且倍性复杂。 据不完全统计,目前全世界约 rbcL + tr

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