连通度问题的三维DNA结构进化算法.pdf

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2017-06-10 发布于河南
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连通度问题的三维DNA结构进化算法

计算机工程与应用 , () ComputerEngineeringandApplications 2007437 41 连通度问题的三维DNA结构进化算法 ,, 123 1 张社民 ,方刚 ,, 123 1 , ZHANGShe-min FANGGang 华中科技大学控制科学与工程系,武汉 1. 430074 陕西理工学院,陕西汉中 2. 723000 西安外国语大学,西安 3. 710061 , , , 1.DepartmentofControlScienceandEngineeringHuazhongUniversityofScienceandTechnologyWuhan430074China , , , 2.ShaanxiUniversityofTechnologyHanzhongShaanxi723000China ’ , ’ , 3.XianInternationalStudiesUniversityXian710061China : E-mailzhangsm@ , ZHANG She-minFANG Gang.ThreedimensionalDNA structuresolutiontoconnectivitybasedonevolutionaryalgo- , , (): rithm.ComputerEngineeringandApplications2007437 41-44. : , Abstract TodeterminetheconnectivityofgraphathreedimensionalDNAgraphstructureandthedetailedproceduresofthe , ( ) algorithm arepresented.Inthispaperweproposeagraphstructureconstructedbyk-armedk=3or4 branchedjunctionDNA , , molecules.Intheproposedprocedurevertexbuildingblocksconsistingof34-armedbranchedjunctionmoleculesareselectively , usedtoformdifferentgraphstructures.Afterseparatingthesegraphstructuresbygelelectrophoresistheconnectivityofthisgraph , canbedetermined.Furthermorebasedonevolutionaryalgorithmenumeratingallthepotentialsolutionsisavoided. : ; ; ; Keywords 3-dimensional