耳聋基因检测与耳聋一级预防-final_培训课件.ppt

* * * * * * * 父母耳聋，孩子个个耳聋 同证婚配：后代100%会耳聋 耳聋基因诊断与遗传咨询实例 聋人婚前进行耳聋基因检查，可避免同证婚配的出现 AA AA AA AA AA 耳聋遗传咨询 AA;bb aa;BB 父母耳聋，孩子正常 Aa;Bb “多基因遗传” ? 携带不同隐性耳聋基因突变的聋人夫妇可生育正常听力的孩子 耳聋基因诊断与遗传咨询实例 耳聋遗传咨询 ？ Bb 正常人群中耳聋基因突变携带率(Bb)为5% 耳聋基因诊断可为遗传性耳聋高危人群提供生育风险评估及预防 BB Bb Bb Bb 耳聋基因诊断与遗传咨询实例 耳聋遗传咨询 C C “线粒体基因母系遗传” ? 携带线粒体耳聋基因突变的人群通过指导可避免药物性耳聋的发生 耳聋基因诊断与遗传咨询实例 耳聋遗传咨询 耳聋基因遗传咨询与诊断 了解病因，帮助确诊 预防下一代聋病的发生 预防亲属或下一代药物性耳聋的可能 耳聋遗传咨询 罕见已知耳聋基因检测 非常见耳聋基因致病患者的分子病因 罕见已知耳聋基因致病？ 罕见已知耳聋基因众多，如何检测？ 罕见耳聋基因检测 本研究所检测的79个耳聋基因 常见的耳聋致病基因：Sanger测序 罕见耳聋基因检测：定向捕获二代测序 可行性分析：OtoSCOPE?芯片（54个已知耳聋基因，2010年，University of Iowa） 79个已知耳聋基因的二代测序（本研究） 2010年二代测序首次应用于已知耳聋基因检测 适宜的检测技术 罕见已知耳聋基因检测 罕见耳聋基因检测 总样本量：183例 经济高效的检测方案 检测方案（二步法） 第一步：常见耳聋基因Sanger测序（所有样本） 第二步：79个耳聋基因二代测序（排除常见耳聋基因致病样本） 二步法优点：节约二代测序样本数量 罕见已知耳聋基因检测 罕见耳聋基因检测 79个已知耳聋基因病因构成图 常见耳聋基因突变：35.5% GJB2: 19.7% SLC26A4：12.0% MT-RNR1: 3.8% 罕见耳聋基因突变：15.8% 罕见已知耳聋基因病因构成：15.8% 罕见已知耳聋基因检测 罕见耳聋基因检测 罕见耳聋基因的异质性强 罕见基因突变分布图 致病突变广泛分布于15个基因中 Novel mutation 91.8%(45/49) Reported mutation: 8.2%（4/49) 新发突变占绝大多数 致病突变是否报道分布图 Orphanet Journal of Rare Diseases?2013,?8:85 罕见已知耳聋基因检测 罕见耳聋基因检测 新耳聋基因克隆与发现 所有已知耳聋基因检测后都为阴性 新耳聋基因致病？ 已知耳聋基因非编码区致病？ 已知耳聋基因大片段缺失？ …… 新耳聋基因克隆 遗传性耳聋家系连锁分析 遗传标记 基因型分离 表型分离 基因型-表型共分离 耳聋基因的定位克隆 新耳聋基因克隆 外显子捕获/二代测序 二代测序 耳聋基因定向外显子捕获/测序平台 排除已知耳聋基因 增加克隆新耳聋基因的把握 新耳聋基因克隆 Genome-Wide Linkage Analysis Performed in 9 affected and 9 unaffected (35 yrs) 新耳聋基因克隆 候选区域 新耳聋基因克隆 Genome-Wide Linkage Analysis 9 affected and 8 unaffected Illumina OmniZhongHua BeadChip (900,015 SNPs) Chr16p13 kgp1005458-kgp2546988 (2.1 Mb) Maxium LOD = 3.8 Overlapped with DFNB86 interval 新耳聋基因克隆 Whole Exome Sequencing 3 affected and 2 unaffected 新耳聋基因克隆 Whole Exome Sequencing Candidate variants: non-synonymous variants (missense, nonsense, splicing site, indels, etc) with allele frequencies ≤ 0.001 II-3 III-9 III-7 III-5 III-11 II-3, III-7, III-9: Affected III-5, III-11: Unaffected