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端粒酶活性检方法的研究进展2008
端粒酶活性检测方法的研究进展2008-10-07 22:00
摘要: 近几年研究表明端粒酶与肿瘤的发生发展密切相关,推测可能是一个广泛的肿瘤标志物。本文就端粒酶活性检测的原理,端粒酶的提取方法,TRAP扩增技术,四种结果分析方法(同位素法、染色法、荧光法和ELISA法)以及如何进行质量控制与半定量测定进行综述。
端粒酶(Telomerase)是由RNA和蛋白质组成的一种核糖核蛋白酶。人端粒酶RNA组分(hTR)于1995年被克隆,其中含有端粒重复序列的模板(5′-CUAACCCUAAC-3′);蛋白质组分具有RNA依赖的DNA多聚酶活性,结构尚不清楚。端粒酶能以自身RNA的模板区为模板复制合成端粒序列。在胚性细胞等增殖活跃的细胞中具有端粒酶活性,而在正常成熟体细胞中端粒酶失活,同时还发现绝大多数肿瘤细胞都呈端粒酶阳性,而在癌旁组织和正常组织阳性率很低,推测端粒酶可能是一个广泛的肿瘤标志物[1]。因此近几年端粒酶在各种肿瘤中的研究日益深入,同时促进了检测方法的改进与完善。本文对其检测方法综述如下。
1 基本原理
端粒酶在体外可以以其自身RNA的模板区为模板,在适宜的寡核苷酸链的末端添加6个碱基的重复序列,用聚丙烯酰胺(PAGE)凝胶电泳可显示6个碱基差异的梯带。1994年Kim建立了基于PCR基础上的端粒重复序列扩增法(telomeric repeat amplification protocol, TRAP)。TRAP反应原理见下图。
首先合成一个18nt的TS做上游引物,端粒酶结合TS末端的GTT并合成agggttag,然后每经过一次转位合成一个ggttag的6碱基重复序列,端粒酶灭活后,加入一个24nt的CX做下游引物,经过多次变性-退火-延伸,扩增端粒酶延伸产物。
2 基本技术方法
2.1 标本来源 手术摘除组织,针吸活检组织,胸水,腹水,膀胱或胰管冲洗液,棉拭子所取分泌物和尿液(尚有争议)等。
2.2 端粒酶的提取方法 早期采用超声等物理破碎的方法在不同细胞中的提取效率差异较大,此后采用去污剂(如CHAPS)裂解的方法在少量细胞获取了较稳定的端粒酶提取液。现详述如下:40~100mg冷冻(-70%℃)组织或104~106沉淀细胞用冰预冷的洗液[10mM hepes-KOH(pH7.5), 1.5mM MgCl2, 10mM KCI, 1Mm DTT]洗1次,10000g4℃离心1min,沉淀加200μl冷裂解液[10mM tris-HCI(Ph7.5), 1mM MgC12,1mM EGTA, 0.1mM PMSF, 5mM β-巯基乙醇,0.5%CHAPS,10%甘油],自动匀浆器冰浴中匀浆,450rpm,25min, 16000g4℃离心20min,移取上清160μl,部分样品用于蛋白定量,其余迅速冷冻,-70℃保存。端粒酶经小于10次冻融可保持活性稳定。部分学者对某些标本用0.5%Tween-20代替0.5%CHAPS获得更好的效果[2]。
2.3 TRAP扩增 50μlTRAP体系包含20mM tris-HCI(pH8.3),1.5mM MgCI,63mM, KCI, 0.005%Tween-20,1mM EGTA, 50μMdNTP,0.1μg tS,1μg T4基因32蛋白,0.1mg/ml牛血清白蛋白,1~2μlCHAPS细胞提取液(含6μg)蛋白,0.2~0.4μl[α-32P]dGIP或[α-32P]dGIP(10μCi/μl, 3000Ci/mmol),这一反应体系可同时满足端粒酶Tap聚合酶的活性需要,23℃10min合成端粒酶延伸产物后,94℃3s灭活端粒酶,加入0.1μg cX和2U Taq酶,94℃30s,50℃30s,72℃1.5min扩增27个循环,25μl产物进行15%PAGE 凝胶电泳。
2.4 引物设计 为了防止上、下游引物之间的结合,在CX引物上设计了3个不匹配碱基(见图1*处),单链结合蛋白T4基因32蛋白可进一步避免引物之间的结合,TS和CX引物被广为采用,在上述条件下,只有延伸了三至更多的GGTTAG片断才有特异扩增,即得到从40bp开始的6bp差异的梯带。Broccoli等以5′-GGCGCG(ACCCTA)3-3′代替CX引物,由于增加了G-C含量,可提高退火温度,进一步避免引物间的结合,增加特异性[3]。Oncor公司设计RP引物代替CX引物,得到从50bp开始的6bp差异的梯带[4]。
3 扩增片断的检测
3.1 同位素法 Kim建立的方法即为同位素法,其应用最多。采用[α-32P]dGTP或dCTP掺入的报道很多,但部分学者用[γ-32P]dATP和T4激酶标记TS引物的5′端,发现更易于检出
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