【2017年整理】基因芯片分析的理论与方法.ppt

基因芯片分析的理论与方法;基因芯片概论;基因芯片分析的概念;基因芯片分析的优点;基因芯片分析的应用范围;发展的方向:从多角度研究揭示生命现象;基因芯片的发展是推动系统生物学发展的动力;利用基因芯片研究生命现象的测略;基因芯片的分类;基因芯片的分类;一些发展中的基因芯片技术平台;基因芯片分析 试验方法;基因芯片分析的主要步骤;cDNA基因芯片分析的主要步骤;cDNA芯片分析的主要步骤;cDNA芯片分析的主要步骤;cDNA芯片分析的主要步骤;Oligonucleotide array （GeneChip?）;;Oligonucleotide array 的特点;Oligonucleotide array 的优越性;芯片分析数据的标准化;Scatter plots for a Cy5-liver/Cy3-liver control hubridization A Cy5-ovarian tumor/Cy3-normal ovary hubridization The value of Cy3 and Cy5 hydridization signals from each clone were plotted directly onto the plot （卵巢癌）;基因芯片数据分析 和信息挖掘方法;一. 聚类分析;聚类分析;;;;聚类分析的目的;聚类结果显示: Cluster, Cluster viewer;二. 基因调控网络分析;2.1 基 本 理 论;定义;原理;;应用;2.2 pathway 数据库介绍;Pathway 数据库;关于GO;;关于KEGG;数据库 KEGG PATHWAY Database KEGG GENES Database KEGG LIGAND Database; KEGG中的通路分为五大类：1． 新陈代谢通路2． 遗传信息处理通路3． 环境信息处理通路4． 细胞内通路5． 人类病症相关通路 PATHWAY提供所选定通路的参考资料、涉及的反应和在其他生物中的通路情况。由GIF等平板文件类型图示，方框显示为涉及的酶EC名称，圆滑框为反应类型，以实线和箭头连接反应物和方向，虚线指向预测的反应类型。;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;关于GenMapp;;关于BioCarta; ;GeneNet;;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;2.3 功能富集分析;功能富集分析定义;MAPPFinder;工作方式;Z值得计算;;GOminer;;Pathway Explorer;;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;ArrayXPath;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;Pathway影响显著性的统计学评估;基于文献的功能富集分析;基于文献的功能富集分析的工具;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd.;QUESTIONS?