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の取り扱い大阪府立大学大学院生命環境科学専攻和
Access とOpenOffice ・Base による
データベース入門
( ゲノムデータベースの取り扱い)
大阪府立大学・大学院生命環境科学専攻
和田野 晃
はじめに
本書はAccess2003 とOpenOffice のBase の応用として、バイオデータベースの扱い
を解説した本です。大阪府立大学の「データベースと情報検索」の授業をするに際して、
あれこれと教科書になる本を検討し、2年間にわたり牧村あきこ氏の「Access--はじめ
てのデータベース」を使用させていただきましたが、内容が住所録を主眼にしており、
生物系の授業にはあまり適しているとは思っていませんでした。そこで「かずさDNA研
究所」のシアノバクテリア遺伝子データベースを教材にすることを試みました。住所録
を教材にするよりも学生の意欲を高めることができそうなので、覚え書きとして教科書
にすることにしました。かずさDNA研究所にはその旨お伝えし、了解を得ました。それ
だけでは、前期15回の授業内容に不十分なので、授業で情報センターの使用に際して
必要なメイリングリストのようなものの作成、系統樹の作成、などを加えました。ただ
著者はデータベースの専門家ではありませんから、その観点からみるとずいぶんいい加
減なところがあるかもしれません。一方、インフォマティクスの観点からみると、これ
も専門ではないのでやはり十分にデータベースをAccessやBaseで論じることも出来て
ないかもしれません。次の世代の先生に引き継いで頂いて、よりわかりやすいインフォ
マティクスのデータベースを扱う教科書ができることを願っています。
2
第1章 メイリングリスト
1-1Active Mail でのメイリングリスト(グループの作り方)
Active Mail を実行すると図1A のような画面が表示される。そこで、オプションを
選択し、住所録をダブルクリックすると1B となる。そこで青字のオプションに戻るの
右隣にあるH をクリックすると住所録のヘルプが表示される(1C)。ヘルプを詳細に読
んでみると、1D のように書いてある。WAV、CSV はそれぞれOutlook の住所録形式、
コンマセパレートバリュー形式の意味で、CSV 形式のファイルを取り込みグループを作
成します。
図1 Active Mail の住所録でグループを作成する。
A B
C D
他のアプリケーションで作成した住所録
ファイルをActive ! mail に取り込むこ
とができます。取り込むことができるフ
ァイルは WAB 形式と、CSV 形式です。
まず、住所録作成で自分のデータを公開できる部分のみ入力し、ファイルの項からエキ
スポート(「別名で保存」するとき、他のソフトで読める形式にする)してみてくださ
い。エキスポートし、保存したファイルをエクセルとテキストエディタで読んでみてく
ださい。図2のような表示が出ると思います。
3
図2 エキスポートしてファイルをエクセルとテキストエディタで表示
コンマで区切られた文の数を調べると、一行目と二行目が同じになっているはずです。
文もしくは単語が入ってない部分はコンマが続けて表示されています。さらにコンマは
全角ではなく半角になっていることに注意します。コンマとコンマの間は、フィール
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