MPICH2安装过程.doc

MPICH2的安装过程 经测试MPICH2的性能非常优越：具有方便的管理操作实现对多核的支持（推荐）From: HYPERLINK /viewdiaryhtml \t _blank /viewdiaryhtmlMPICH2软件包的安装MPICH2是与MPI-2相对应的MPICH实现版本，包含了MPI-2相对于MPI-1扩充后的一些功能，比如动态任务管理，并行I/O等。当前必威体育精装版版本是MPICH2-1.0.2. （1）? ?? ?下载MPICH2源程序包mpich2-1.0.2p1.tar.gz（ HYPERLINK /mpi/mpich2/ \t _blank /mpi/mpich2/）。 （2）? ?? ?解压源程序包到当前目录下：tar zxf mpich2-1.0.2p1.tar.gz,此时会得到一个名为mpich2-1.0的子文件夹。 （3）? ?? ?创建一个安装目录（比如/home/transim/mpich2,默认为/usr/local/bin），为了以后使用方便，可以将此安装目录共享到其他所有将要运行mpich2的节点机上；否则就需要分别在其他机器上安装mpich2。如果不创建安装目录，则在下面的configure步骤中会自动创建安装目录。 （4）? ?? ?选择一个编译目录，最好将编译目录与源代码目录分离开，以便能保持一个干净的源代码用来在其他机器上重新安装。比如将源代码拷贝到/tmp/mpich2下。 （5）? ?? ?配置MPICH2,指定安装目录，并在编译目录下运行configure脚本。 如：cd /tmp/mpich2 ./configure –prefix=/home/transim/mpich2 21 | tee configure.log (6) 编译链接MPICH2：make 21 | tee make.log (1)安装MPICH2：make install 21 | tee install.log (2)将安装目录中子目录bin加入到环境变量PATH中： setenv PATH /home/transim/mpich2/bin:$PATH? ?? ?(csh或tcsh) export PATH=/home/transim/mpich2/bin:$PATH? ?? ? (bash或sh) 用以下命令检查安装是否成功： which mpd which mpicc which mpiexec which mpirun 所有以上的命令都应该指向安装目录的bin子目录。此外，如果没有用NFS来共享安装目录，则需要将bin子目录拷贝到其他每台机器上。 （9）与MPICH不同的是，MPICH2使用一个外部进程管理器来启动MPI任务，默认管理器为MPD。为了安全考虑，MPD需要有哪些信誉好的足球投注网站用户主目录下的文件.mpd.conf，文件中包含：secretword=secretword,其中secretword应该是一个只有用户知道的字符串（最好不要与用户密码相同），将此文件权限设置为只有所有者可读及可写。 （10）用以下命令检查测试MPICH2在本机是否已正确安装并可以启动： Mpd ? ?（启动mpd） Mpdtrace? ? (输出应该是本机机器名) Mpdallexit? ? （退出mpd） ??（11）? ? 在mpd下运行非mpi程序测试： mpd mpiexec –n 1 /bin/hostname? ?? ? (输出本机机器名) mpdallexit（12）配置所有机器，使用机器间采用rsh或ssh互相访问时不需要输入密码。配置完后可用以下命令进行测试： ssh hostname date? ???或? ?? ? rsh hostname date (13)使用mpd.hosts文件来启动文件所列机器上的mpd： mpdboot –n number to start -f mpd.hosts 在以上命令行中所要启动的机器数量必须小于等于mpd.hosts文件中所列的机器数，即使同一台机器名在文件中出现多次，默认情况下在每台机器上只启动一个mpd。在各台机器启动mpd后，运行mpdtrace，应该输出每台机器的机器名称。 若不能启动所有机器上的mpd，可采用手动方法来启动，方法如下： 在本地机器上运行： mpd ? ?? ?? ?? ?? ? （启动本地mpd守护进程） mpdtrace –l? ?? ?? ? （输出本地mpd守护进程的主机名及端口号） 然后登录到其他机器，运行： mpd –h hostname -p port hostname及port都为刚