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临床PCR试剂盒的选用和质检 卫生部临床检验中心 李金明 PCR或RT-PCR试剂盒的组成 核酸提取试剂 核酸扩增或逆转录-核酸扩增试剂 产物检测试剂(有些使用全自动分析仪的PCR方法因其核酸扩增和检测同时完成,故无专门的产物检测试剂) 影响PCR试剂盒质量的因素 内在因素: 原材料、核酸提取方法、方法学设计 影响PCR试剂盒质量的因素: 扩增所需的原材料 寡核苷酸引物和探针 缓冲液和dNTP 聚合酶、逆转录酶等 PCR反应混合物 寡核苷酸引物和探针 其对试剂盒质量的影响首先是纯度。纯度的判断可根据260/280吸光度比值来判断,如?2.0,则需重新纯化。另一种方法是将其在聚丙烯酰胺凝胶上电泳,如出现一条以上的带或迁移位置错误,则需重新纯化。 是否有污染。 结合特异性(浓度) dNTP和缓冲液 dNTP(包括dATP 、dCTP、 dGTP和 dTTP或 dUTP)的浓度 缓冲液:在储存和扩增循环中稳定、作为聚合酶活性所必须的Mg++(或用于rTth的Mn++)的浓度以及pH等 逆转录酶、DNA聚合酶 酶的浓度 酶的活性 核酸扩增方法 PCR RT-PCR 转录依赖的扩增(TMA) 连接酶链反应(LCR) 链替代扩增(SDA)等 影响PCR试剂盒质量的因素: 核酸提取 核酸提取的有效性 核酸提取的简便性 影响PCR试剂盒质量的因素: 产物检测 杂交固相 特异探针及其标记物 影响PCR试剂盒质量的因素 内在因素: 原材料、核酸提取方法、方法学设计 外在因素:试剂盒的运输和贮存外在因素:试剂盒的运输和贮存 试剂盒的运输和贮存 PCR试剂盒的有效期一般为6个月,这是指在适当的贮存温度下。核酸扩增部分的试剂一般要贮存于-20℃下;产物检测部分试剂则贮存于2~8℃。 试剂盒从厂家到用户手中,均要经历运输及运输中的贮存,任一环节的不当,均会影响试剂盒的临床使用质量。 PCR试剂盒的分类 定性测定:PCR-ELISA、PCR-膜上杂交(杂交梳)、荧光PCR(分子信标和Taq Man等) 定量测定: PCR-ELISA 、Taq Man和Amplisensor荧光定量、 Amplicor PCR-ELISA定量等。 PCR试剂盒的选用原则 参考试剂生产厂家的信息广告 参考同行对有关试剂盒的使用效果 参考有关机构的综合评价 根据使用目的 根据所在实验室的技术特点 根据所在医院患者的承受能力 PCR试剂盒的质检 外包装:厂家名称、检测目的、批准文号、批号和有效期等。 内包装:试剂瓶是否漏液、真空包装是否破损以、试剂是否齐全以及是否有使用说明书等。 PCR试剂盒的质检(定性测定) 性能质检 采用血清(样本)盘(Panel)质检: PCR试剂血清(样本)盘由一定数量的原血清阴、阳性样本、2~3份纯化核酸(DNA或RNA或cDNA)样本以及3~5份系列稀释阳性样本所组成。样本总数可定在20份左右。 原血清样本用于判断试剂盒对特定病原体核酸检出的特异性、灵敏度和符合率;纯化核酸样本用于判断DNA扩增或逆转录及DNA扩增的有效性;系列稀释阳性样本用于判断试剂的测定下限。 试剂特异性、灵敏度和符合率计 算 公 式 试剂特异性、灵敏度和符合率计 算 公 式 灵敏度(%)= (a / a+c)?100% 特异性(%)= (d/b+d) ?100% 符合率(%)= (a+d/a+b+c+d) ?100% PCR试剂盒的质检(定量测定) 样本:已知浓度的高、中、低三种浓度质控物。 质检内容:测定的重复性 测定范围 抗干扰能力 技术验收 依据: 《临床检验扩增检验实验室管理暂行办法》 卫医发[2002]10号 《临床基因扩增检验实验室工作规范》 卫检字2002第8号 技术验收内容 实验室设置和设备 设施和环境 人员 设备管理 检测方法 标本管理 记录 报告 质量控制 抱怨 等十章共三十八条 实验室设置和设备 本章共七条。 实验室分区:规范化分区、明确的识别标记 防污染:空气流向、中央空调、各区间的封闭性 各区仪器设备物品配备:充分性、科学性、专用性(标识) “生物安全柜” “可移动紫外灯” “加样器” 设
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