串联重复序列的物种差异及其生物功能.PDF

动 物 学 研 究 ， （）： !# $% ’ !( # ### ) #(* +, #- ) .*/ 0 122, !#* ) #3#- 4556578%96 :;;9=% 串联重复序列的物种差异及其生物功能 ，， ， ! # ! 高 焕 ，孔 杰 （ 中国水产科学研究院黄海水产研究所 农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室，山东青岛 ； !’ $$% ! 中国科学院海洋研究所，山东青岛 ； 中国科学院研究生院，北京 ） ’ $$% ! # ’ !%%%#’ ： 摘要 串联重复序列是指! ( %% 个碱基左右的核心重复单位，以头尾相串联的方式重复多次所组成的重 复序列。它广泛存在于真核生物和一些原核生物的基因组中，并表现出种属、碱基组成等的特异性。在基因组 整体水平上，各种优势的重复序列类型不同。即使在同一重复序列类型内部，不同重复拷贝类别 （如 、 )* )+ 等）在基因组中的存在也表现出很大的差异。同时，这些重复序列类型和各重复拷贝类别在同一物种的不同染 色体间，以及基因的编码区和非编码区间也表现种属和碱基组成差异。这些差异显示了重复序列起源和进化的 复杂性，可能涉及到多种机制和因素，并与生物功能密切相关。另外，由于重复序列分析软件和统计标准还存 在算法、重复长度、完美性等问题，需要进一步探讨。此外，串联重复序列的自身进化关系、全基因组水平上 的进化地位、在基因组中的生物功能、重复序列数据库建立和应用研究等，将是今后研究的主要课题。 关键词：串联重复序列；微卫星；小卫星；基因组；起源与进化 中图分类号： ； ； 文献标识码： 文章编号： （ ） ,#! ,- ,.!’ ) %-/ 0 -.-# %%- %- 0 % 0 %!% ?8=8@A85B +9=9%;=88% 9BC D856578%96 EAB%85B 5F G9BC;H :;I;9 2;JA;B%; 8B ; K;B5H; 5F ?8FF;=;B $=79B8H !# $%’!( ( # ( )#*! +,-!( !! #$% ’()*’+)*% , )* -./+’01’(2$ 3+0204’+0)1 ), 5’*01$ 60/7$*0$/ 8$/).*9$/ : 5010/+*% ), ;*09.