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实验总结 通过上网查询实验原理以及董洁老师、杨帆、杨曦师兄、艺馨、李扬师姐等的指导,对如何从血样中提取高质量的全基因组DNA有了一个较清楚的认识。 下一步实验计划 为了进一步加深对原理的理解,以及提高提DNA的实验操作技能,计划在董洁老师的指导下,独立完成整个实验操作,并且针对前几次操作过程中不规范的地方加以改正。 谢 谢! 实验目的 学习高质量血样DNA的提取,理解DNA提取操作原理,在提取过程中学习离心机、Vortex等的使用 实验原理 应用物理、化学等方法从病人血样中提取较纯的全基因组DNA 静置后的血液 血液主要成分 血液 血细胞 血浆 红细胞 白细胞 血小板 血浆蛋白 水 其他物质 无机盐、葡萄糖、氨基酸 血细胞种类 红细胞 白细胞 血小板 数量 特征 最多 最少 1.成熟红细胞无核,两面凹的圆饼状。 功能 2.含血红蛋白,红色。 1.体积比红细 胞大。 2.有核,种类 繁多。 1.体积最小, 无核。 血细胞特征比较 适中 促进止血,加速凝血 防御保护 运输氧气和部分二氧化碳 血浆主要成分 结论 血样各种成分中,只有白细胞含有DNA。 物理方法 离心机(型号:S×4250) : 沉淀 Vortex-5:混匀 化学试剂 溶血液: 9ml 作用:溶解红细胞、白细胞、血小板 白细胞核悬浮液:2ml 作用:使白细胞核充分悬浮(悬浮主要靠物理方 法:vortex) 白细胞核裂解液:2ml 作用:裂解白细胞核,使DNA释放 化学试剂 蛋白沉淀液:1.33ml 作用:使Pr变性沉淀 异丙醇:4ml 作用:洗涤并沉淀DNA 70%乙醇:3ml 作用:洗去较难挥发的异丙醇、盐离 子等 实验操作 血样→ 加溶血液 → 离心 → 加核悬浮液→ 加核裂解液(立即震荡可过夜)→ 加蛋白沉淀液(立即震荡20s) → 离心→ 留上清,加入异丙醇→ 离心→ 留沉淀,加70%乙醇→ 加TE→ 测OD 实验操作 步骤一: 血样 溶血液 细胞碎片、白细胞核 溶血液:( NH4Cl:155mM , NaHCO3 :10mM , EDTANa2:1.0mM ) 注意事项 能否提到高质量的DNA,好的血样是首要前提,故采集的血样应置于冰箱保存,并尽早进行DNA提取; 做好标记:15ml离心管、1.5ml EP管均需首先进行标号; 移液管使用前必须消毒,减少污染; 移液管顶部要塞上棉花,防止反应液吸入 移液枪内; 注意事项 从冰箱中取出血样时,要小心、不宜晃动,否则容易导致弃去血浆时,损失白细胞; 补加溶血液时,应加至离心管12ml,即加入的溶血液体积应是原血样的3倍左右; 溶血5min后,在灯下看管内有无血块→If 有,可进行二次溶血; 实验操作 离心机:4000 rpm 5min 4℃ ,使白细胞核 沉淀,弃去细胞碎片等大部分杂质 步骤二: 细胞碎片、白细胞核 离心 沉淀:白细胞核、少量杂质(血红素、RNA、蛋白) 注意事项 离心前注意配平,一则保护离心机,二则使离心效果更佳→ If 沉淀不紧密,可置于冰上5min,再离心一次。 离心后,沉淀是白细胞核团, 离心管倒扣于吸水纸的时间不宜太长,也不宜反复倒残余液,否则易导致白细胞核团损失。 血红素 注:血红素可通过其卟啉环与Taq酶的不可逆 结合而抑制 Taq酶活性,对DNA的后续 应用造成影响,必须尽量除尽 血红素的除去 血红素溶于水,所以可以在洗涤过程中被除去, 当离心后的细胞核基本不带红色,说明血红素基本已除尽 RNA 由于RNA基本上存在于细胞质中,因而细胞膜破裂后,存在于上层液体中,离心后大多数已经除去。 实验操作 步骤三: 沉淀:(白细胞核、少量杂质) 细胞核悬浮于溶液中 白细胞核悬浮液 悬浮液:( Tris-HCl:50mM、PH=8.0 , NaCl:150mM (=生理盐水:0.9%?), EDTANa2:20mM ) 白细胞核的悬浮主要是vortex的功劳,因而要立即并充分 vortex 实验操作 步骤四: 细胞核悬浮液 细胞核裂解液 DNA、大量蛋白、RNA、盐类 微量血红素 核裂解液: ( Tris-HCl , NaCl , EDTANa2(以上各溶度
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