LncRNA and circRNA研究原理.pdf

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LncRNA and circRNA研究原理

LncRNA研究策略 1 LncRNA (long non-coding RNA )简介 LncRNA是RNA聚合酶II转录的产物 ,具有poly A尾结构 ;不编码 蛋白 ;物种间不保守 ;通常位于核内 ; small non-coding RNA (sncRNA) (20-200nt) non-coding RNA (20-20000nt) long non-coding RNA (lncRNA) RNA (200-20000nt) mRNA 2 LncRNA已知功能 1) 在编码蛋白基因的上游启动子区 (橘色 )转录 ,从而 干扰邻近蛋白编码基因 (蓝色 )的表达 2) 抑制RNA 聚合酶 Ⅱ ,或介导染色质重构和组蛋白修 饰 ,而影响基因 (蓝色 )表达 ; 3) lncRNA (紫色 )与编码蛋白基因的转录本形成互补 双链 ,干扰mRNA的剪切 ,进而产生不同的剪切形式 ; 4) lncRNA (紫色 )与编码蛋白基因的转录本形成互补 双链 ,在Dicer酶作用下产生内源性的siRNA ,调控基因的 表达水平 ; 5) lncRNA (绿色 )结合在特定蛋白质上调节相应蛋白 的活性 ; 图  lncRNA的八种作用方式 6) 作为结构组分与蛋白质形成核酸蛋白质复合体 ; 7) 结合在特定蛋白上从而改变该蛋白的胞质定位 ; 机制切入点: 抑制基因表达; 8) 可作为小分子RNA (如miRNA )的前体分子或者 引导DNA-蛋白结合; miRNA的反义抑制分子。 染色质重构,表观调控 3 Wilusz et al. Genes Dev. 2009. 23: 1494-1504. PMID:  LncRNA医学基础研究策略 临床/动物实验 样本收集 Gain of Function 汉恒强项 LncRNA功能验证 品质保证 差异LncRNA筛选 Loss of

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