1.800bp前信号读值突然中断；.PDF

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2017-06-20 发布于江苏
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1.800bp前信号读值突然中断；

中断 1. 800bp 前信号读值突然中断; 2. 起始峰图很好，背景峰迅速升高并干扰主峰读值。 Raw 图实例：可能的原因： 1.发卡结构/RNAi/shRNA—外显子和内含子交界处形成发卡结构（mRNA成熟中剪切机制的一部分）； 2.GC-rich—导致解链不充分； 3.重复序列。解决方案： 1.建议客户如果知道自己样品有特殊结构（发卡结构、困难模板、RNAi、GC-rich），可在订单中标注出来，我们会直接安排特殊方案测序； 2.可以尝试在现有测序引物的上游或下游设计引物测序，或者在相反方向设计引物测序。（如果二级结构连接相对较弱，可以通过在另一个位置设计引物测通困难区域）； 3.对于由于重复序列导致的中断（polyG 和polyC 除外），唯一的解决方法是在另一个方向设计引物。我们的特殊方案（DGC 和P5.1）对重复序列导致的中断没有作用。