一、EST数据分析平台的构建.ppt

EST数据分析平台的构建 石河子大学动物科技学院 贾 斌 一、硬件介绍： 1、个人电脑(PC机) 2、PC Cluster(集群) 3、小型服务器 4、大型机 二、Unix操作系统及其常用命令简介(man、ls、cd、more、rm、mkdir、chmod、gzip、tar) 三、常用EST数据分析软件的安装： 例：1、BLAST 2、ClustalW 3、InterProScan 4、Perl 一、硬件介绍 1、个人电脑(较少数据，简单运算): EST分析所需的基本配置： ? 处理器：1.7G CPU； ? 内存：518MB以上；(BLAST：4000条EST与nt库比对，30MB) ? 硬盘：50GB以上； 一组完整的计算机互联，作为统一的计算资源一起工作，并有一台机器的印象。 优点： 自由组装，良好的可扩展性； 性价比高； 抗突发性； 速度快。 缺点： 不够稳定。 品牌：IBM、 HP、 SUN、Intel、DELL、曙光、浪潮、联想、方正等。 外形：塔式、机架式、刀片和机柜式。 选购标准： （1）稳定性能（最重要） （2）针对性原则 （3）够用原则 3、小型服务器 低档配置 中档配置 高档配置 CPU Xeon DP 2.6G*1 Xeon MP 3.0GHz*1 Xeon MP 3.0GHz*2 Opetron 2.0G*1 Opteron 2.6G*2 (Intel) 缓存:512KB 缓存:1024KB 缓存:8192KB (AMD) 1024KB 1024KB 内存(标准) 512MB 1024MB 1024MB*2 (最大) 4096MB 30786MB 30786MB (工作频率)133MHz 266MHz 400MHz 硬盘 73G*2 73G*2 0 价格 7000-10000元 14000-16000元 20000-40000元 3、小型服务器（数据安全） 3、小型服务器 缺点： ◆ 价格较高； ◆ 操作系统、设备和部件比较专用，用户 本身维护困难； ◆ 可扩展性不强。 一般指system/360 开始的一系列的IBM计算机；也可以指其他厂商制造的兼容系统。 特点：并行性； 软硬件协同。 优点：高可靠性； 高可用性； 高服务性。 缺点：设备昂贵； 维护困难； 可扩展性不强等。 二、Unix/Linux及其常用命令简介 1、Unix概述： 功能强大的操作系统，管理计算机资源。 典型的服务：执行新程序； 打开文件； 读文件； 分配存储区等。 2、不同风格的Unix： 1） Linux: ① 自由软件(免费、修改、传播)； ② 具有Unix的全部功能； ③ 对硬件要求低； ④ 稳定。 比较流行的版本：Red Hat Linux、 Turbo Linux 、Slackware Linux、SuSe Linux。 主要特点： （1）开放性; （2）多用户; （3）多任务; （4）良好的可移植性; （5）可靠的安全系统 ：对读、写控制、带保护 的子系统、审计跟踪、核心授权等。 2）其他常见的Unix