PRM技术-针对无抗体蛋白的验证新技术.pdf

Contents PRM定量产品 PRM技术相关产品 • 产品定义 • 产品介绍 产品特点和应用 PRM原理 项目分析流程 报告和结果展示 应用案例 产品定义 • 组学验证产品 ——用于label free, iTRAQ, TMT, SILAC等相对定量蛋白 质组学数据的验证（目的等同于WB ） • 个性化定制 ——对复杂样本中的目标蛋白质进行靶向定量分析： 1 ）相对定量：目的等同于WB 2 ）绝对定量：目的等同于ELISA 产品特点和应用 个性化定制——相 个性化定制——绝 产品 组学验证产品 对定量 对定量 采用相对定量方法验证蛋白 实现复杂样本中目标蛋白质的验证和定量分析 应用范围 质组学（如iTRAQ, TMT, labelfree, SILAC）的结果 相对定量 绝对定量 采用通用同位素内标 采用同位素形式的目标 采用通用同位素内标进行相 定量特点 进行相对定量的数据 蛋白质/肽段绘制标准 对定量的数据矫正 矫正 曲线，进行定量 样本需求 同蛋白质组学或参考 需参考文献或者预备实 量和制备 同蛋白质组学 文献 验结果 方法 与传统SRM/MRM方法比较的优势 ——升级版MRM • 1）高分辨离子监测，质量精度达ppm级，在不损失灵敏度的情况下，最大程 度地排除了背景干扰； • 2）二级为全扫描，无需事先确定离子对和优化碰撞能量，只需要在数据处理 时选择响应最高的一个或几个子离子，即可提取母子离子对的色谱峰进行定 量，线性范围可达到5-6个数量级； • 3）同时定性与定量分析，二级全扫描谱图用于定性分析，选择其中最佳的子 离子提取离子对即可完成定量分析。 PRM技术原理 平行反应监测 Parallel reaction monitoring (PRM)  PRM是相对于传统的SRM建立起来的高分辨离子监测技术。PRM基于Q-Orbitrap 为代表的四级杆-高分辨质谱平台，与SRM每次扫描一个Transition不同，PRM 每次对一个母离子产生的所有Transition进行全扫描，即平行监测了一个母离 子对应的所有离子对。 组学验证产品——项目分析流程 来源于APT的蛋白质组学数据 其他来源数据 客户提供 • 质谱鉴定和定量蛋白质列表； 蛋白质列表 • 质谱鉴定肽段信息（肽段得 分，二级图谱） 项目初判 候选肽段筛查 样本制备