同时检测多种食源性致病菌的寡核苷酸芯片=Developmentofan.DOC

 同时检测多种食源性致病菌的寡核苷酸芯片=Development of an oligonucleotide-based microarray to detect multiple foodborne pathogens [关键词] 食源性致病菌；芯片；多重PCR；检测 研究开发设计了针对大肠杆菌O157：H7、沙门氏菌、单增李斯特菌等病原体的特异的70-mer探针应用于开发的病原体检测芯片。为了降低检测成本，每个芯片的晶片都设计制作为可容纳同时分析12个不同样本的12组成分。为了达到较高的检测灵敏度和特异性，在芯片分析前先进行特异的DNA片段扩增而不是全基因组的随机扩增。在含有靶序列的14种PCR扩增片段，芯片能高效的区分这4个病原体，且检测灵敏度为 10-4ng的基因组DNA。应用该法对39个鲜肉样本检测，发现16个样本被1-2种病原体污染。在同一样本中可同时检测到沙门氏菌和大肠杆菌O157：H7，沙门氏菌和单增李斯特菌。总的来说，芯片分析结合多重PCR检测方法能够有效地检测食物样本中的单个或多个病原菌，同时结合病原菌毒力提供了重要的基因型信息。(Molecular and Cellular Probes，24：77–86，2010) Sensors and Actuators B，145：543–552，2010) Biotechnology Advances，28：232–254，2010Journal of Virological Methods， 163： 87–95，2010Radiation Physics and Chemistry ，79：731–7342010) 宿主与胞内寄生菌相互作用的微阵列研究=Review of microarray studies for host–intracellular pathogen interactions [关键词] 微阵列；致病性；毒力；寄主病原体的相互作用；绝对胞内寄生菌 本文总结了通过微列阵方法研究胞内寄生菌浸染时有限的技术及提高微列阵方法应用的策略；使用微列阵技术对绝对胞内寄生菌的比较基因组学和基因表达分析时的普遍应用；微列阵方法结果显示，绝对胞内寄生菌的基因组高度保守，而潜在发生的遗传多态性时可以提高其致病性。另外，当环境改变时，沙眼衣原体会改变它的基因表达，而普氏立克次体、立氏立克次体、立克次氏体伤寒、葡萄球菌B 组链球菌和沙眼衣原体的基因表达谱也会改变。基因表达分析提高了对绝对胞内寄生菌适应环境改变能力和对寄主防御潜在适应的认识。(Journal of Microbiological Methods， 81 ：81–95，2010Early View，2010) 使用多重磁珠捕获杂交和多重实时PCR技术检测海鲜中病原体=A multiplex magnetic capture hybridisation and multiplex Real-Time PCR protocol for pathogen detection in seafood [关键词] 磁珠捕获杂交（MCH）；多重实时PCR；海鲜；单增李斯特菌；沙门氏菌 研究一套应用程序包括一个使用经氨基改良的顺磁性的纳米粒子以捕获寡核苷酸的多重磁珠捕获杂交（mMCH），从而可以同时对沙门氏菌和单增李斯特菌的DNA从海鲜中分离进行分析，然后按照ISO 22174使用含有内部控制（IAC）的三重实时PCR扩增分析。在含有目标菌10个基因组的体系中同时扩增，检测率为100％。使用完整的分子生物学方法测试了人为污染一个或两个已知数目目标菌（1-103 cfu/g）的生和熏制的鲑鱼片，经直接或富集培养后的结果与标准方法一致。结果表明经直接或富集后再检测，两种方法间完全一致；在富集样品中灵敏度为1cfu/g，而通过分子方法对接种了102-103cfu/g的样品不经富集其灵敏度更高。使用本研究的方法鉴定被单增李斯特菌自然污染的烟熏鲑鱼检测时间大为缩短。(Food Microbiology，Early View，2010)Current Opinion in Biotechnology，21：1–5，2010在海湾中制造上升流刺激无害海藻的生长=Controlled artificial upwelling in a fjord to stimulate non-toxic algae关键词人造上升流贻贝养殖有毒海藻峡湾夏季峡湾表面海水的初级