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第三章 病毒的分类与命名
第三章 病毒的分类与命名 自从1898年贝杰林克(Beijerinck)首次提出“病毒”的概念以来,已经过去100多年时间。病毒的种类已发展到5450多种; 为了使如此多的病毒种类能够得到科学的命名和分类,国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV)已提出和多次修订了病毒的命名和分类原则,并且建立了由目、科(亚科)、属和种分类阶元构成的病毒分类系统; 目前病毒分类学这一门重要的基础学科已开始走向完善和逐渐成熟起来。 第一节 病毒的分类与沿革 第二节 关于病毒命名的问题 第三节 病毒分类的原则 第四节 病毒分类系统 1、病毒的主要类群 传统上,以“原始寄主”来将病毒划分为若干类群。 “原始寄主”指病毒的反应首先引起人类注意的寄主。 目前,从原核生物的细菌、支原体、放线菌、立克次氏体、蓝藻等; 真核生物的藻类、真菌。。。。。。 脊椎动物乃至人类中都能分离到病毒。 其中,从细菌、被子植物、节肢动物、脊椎动物和人类中找到的病毒最多; 1、原核生物病毒 几乎所有的细菌均找到与相应的噬菌体; 噬菌体具有寄主专一性; 科、属、种甚至不同菌株的噬菌体不能相互感染。 2、真核生物病毒 植物病毒 高等植物普通存在病毒,且绝大多数属于RNA病毒,但花椰菜花叶病毒和双链病毒组则属于DNA病毒。 珊瑚轮藻病毒是第一个发现的具有感染性的真核藻类病毒; 动物病毒 无脊椎动物中,昆虫的病毒病最多。 脊椎动物中,鱼类病毒至少有35种(如草鱼出血病)。 鸟类、禽类、哺乳动物、人类等 2、病毒分类的沿革 1961年以前:各自研究领域的科学家提出或建立一些分类系统,但进展缓慢,且缺乏国际间的协作; Holmes (1944)的拉丁双名分类法 病毒目(Virale):三个亚目:细菌病毒亚目(Phagineae)、植物病毒亚目(Phytophagineae)及动物病毒亚目(Zoophagineae) 1962年--1966年:建立起国际病毒命名委员会(International Committee on Nomenclature of Viruses, ICNV) 1966--1970年:Wildy任国际病毒命名委员会主席期间,组织国际间的协作,发表了ICNV的第一次报告。 病毒的分类与命名中,描述并划定了43个属(群)及其成员,其中动物病毒分成22个属,植物病毒分为15个组(群),细菌病毒分成6个群 1971--1999年: 1973年5月,改名为国际病毒分类委员会(International Commuttee on Taxonomy of Viruses, ICTV). 此后,病毒分类以多次修改充实。 1999,由Pringle执笔公布国际病毒分类委员会第七次报告的检索表,设立3个病毒目,64病毒科,9个病毒亚科,233个病毒属。 2000年,ICTV第七次国际病毒分类报告中植物病毒分类进展较大 共列出15科,73属 2005年,ICTV第八次国际病毒分类报告中新增了9个科、2个亚科、56个属,约400个病毒种 第二节 关于病毒命名的问题 俗名:以寄主俗名加上症状特点组合起来的命名方式。 烟草花叶病毒(首先在烟草上发现,引起烟草叶子出现深浅不一绿色花斑) Tobacco mosaic virus, TMV 病毒的宿主多样性,同一病毒可在不同的宿主中寄生并致病。 二、病毒分类和命名的规则 (一)一般规则 (1)病毒分类和命名应该是国际性的,并且普遍适用于所有的病毒。 (2)国际病毒分类系统采用目(order)、科(family)、亚科(subfamily)、属(genus)、种(species)、分类阶元。 (3)ICTV不负责病毒种以下的分类和命名,病毒种以下的血清型、基因型、毒力株、变异株和分离株的名称由公认的国际专家小组确定。 (4)人工产生的病毒和实验室构建的杂种病毒在病毒分类上不予考虑,它们的分类由公认的国际专家小组负责。 (5)分类阶元只有在病毒代表种的特性得到了充分了解和在公开出版物上进行过描述,以致于明确了它们的分类地位,并使其分类阶元与其他类似的分类阶元相区别时,才能确定下来。 (6)当病毒有明确的科、而分属未确定时,这一病毒种在分类学上称为该科的未确定种(unassigned species)。 (7)与规则2各分类阶元相关联,并得到ICTV批准的名称是唯一可以接受的。 (二)目的规则 目是一群具有某些共同特征的科。 目名的词尾是“…virales”。 (三)科的规则 科是一群具有某些共同特征的属(无论这些属是否构成亚科)。 科名的词尾是“…viride”。 (四)亚科的规则 亚科是一群具有某些共同特性
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