微生物分子生态学进展_综述_.pdf

应用与环境生物学报 　1999 ,5 ( Suppl) :43～48 　 　 Chin . J . Appl . Environ . Biol . 　 　 微生物分子生态学进展 [ 综述] 刘志培 　杨惠芳 ( 中国科学院微生物研究所 　北京 　100080) 关键词 　微生物分子生态学 ; 杂交 ; PCR ; 变性梯度凝胶电泳 ; 核糖体 RNA 基因 中图法分类号 　Q938. 1 Q734 AD VANCES IN MOL ECULAR MICROBIAL ECOLO GY L IU Zhipei YAN G Huifang ( Institute of Microbiology , Chinese Academy of Sciences , Beij ing 　100080) Abstract 　This paper summarizes some molecular techniques applied in the studies on microbial ecology , such as hybridization of nucleic acid probes , ampification of polymerase chain reaction , denaturing gradient gel electrophoresis and analyses of ribosomal RNA gene sequences , and the progress , performance , achievements and advances made from the researches of microbial ecology in recent years by using these molecular tech niques. Keywords 　microbial molecular ecology ; hybridization ; polymerase chain reaction (PCR) ; denaturing gradient ( ) gel electrophoresis DGGE ; ribosomal RNA gene 现代分子生物学技术在生态学研究中的应用大大推动了微生物生态学的发展 ,导致了微生物分子生态 学的产生. 微生物分子生态学方法弥补了传统的微生物生态学方法的不足 ,使人们可以避开传统的分离培养 过程而直接探讨自然界中微生物的种群结构及其与环境的关系. 微生物生态学研究中采用的分子生物学方 法主要有核酸探针技术 、PCR 扩增技术 、rRNA 序列同源性分析方法 、剃度凝胶电泳方法等. 这些技术方法的 采用 ,取得了一系列重要的成果和微生物生态学研究中的突破[ 1～6 ] ,使得对某些微生物的研究成为可能 ,并在 分子水平上阐述了生态问题的机制. 1 　核酸探针杂交技术 核酸杂交技术快速 ,能灵敏地探测出环境微生物中特殊的核酸序列 ,并且用光密度测定法可直接比较核 酸杂交所得到的阳性条带或斑点就能得出定量的结果 ,从而反映出相关微生物的存在及功能. 标记核苷酸探针可直接用来探测溶液中、固定在膜上或细胞或组织内的同源核酸序列.