海岛棉抗黄萎病相关基因GbEDS的克隆与生物信息学分析本科.docVIP

编号NO.： 河北农业大学本科毕业论文 论文题目 海岛棉抗黄萎病相关基因GbEDS1 的克隆 与生物信息学分析 学生姓名 刘通 学号2009014010216 成绩 86.3 学院 农学院 专业班级 农学0902 指导教师姓名 张艳 指导教师职称 讲师 材料目录： 1、任务书 （ 1 ）份 2、开题报告 （含文献综述） （ 1 ）份 3、指导教师评阅书 （ 1 ）份 4、答辩记录表 （ 1 ）份 5、论文正文 （ 1 ）份 6、其它材料 河北农业大学 本科毕业论文任务书 学 院： 农学院 教师姓名： 张艳 职 称： 讲师 2012年5 月4 日 专业名称 农学 论文 题目 海岛棉抗黄萎病基因GbEDS1 的克隆与生物信息学分析 题目 来源 国家自然科学基金 目的意义： 我国目前推广的棉花品种抗黄萎病性能差，不能满足市场的需要。因此，培育抗黄萎病棉花品种，是当前棉花育种迫切需要解决的问题。近年来，植物发育生物学研究取得了突飞猛进的发展，许多重要的发育机制在分子水平上得以阐明，这就为利用遗传工程的方法改造植物生长发育过程奠定了基础。抗黄萎病基因的研究能为品种改良提供依据，具有显著的学术理论价值和潜在经济价值。 本研究利用RT-PCR和RACE技术从海岛棉克隆抗黄萎病相关基因EDS1的cDNA及开放阅读框序列（Open reading frame，ORF），并通过生物信息学分析，以预测该基因在棉花抗黄萎病过程中所起的作用，为基因功能验证提供理论依据。GbEDS1基因cDNA全长2190bp，开放阅读框长1848bp。 对该基因进行生物信息学分析预测其功能并为其功能的研究奠定理论依据。 从棉花样品中高效地提取完整的RNA，由于其植物体内多糖多酚含量高，给提取带来难度。 2013.3.1-2013.3.15: 查找国内外相关文献，学习与本试验有关的实验技术，制定实验方案。 2013.3.15-2013.3.25：提取棉花总RNA，获得质量较高的RNA，进行cDNA的片段合成。 2013.3.25-2013.4.25：设计并合成相关引物，扩增棉花相关基因GbEDS1及全长ORF，克隆并测序。 2013.4.25-2013.5.10：对基因进行生物信息学的分析，从而预测基因的功能。 2013.5.10-2013.5.30：整理实验材料，撰写论文，准备答辩。 GbEDS1的克 隆与生物信息学分析 学 院： 农学院 学生姓名： 刘通 专 业： 农学 班级学号： 2009014010216 指导教师姓名： 张艳 指导教师职称： 讲师 2012 年 6 月5 日 学生姓名 刘通 专业班级 农学0902 学 号 2009014010216 指导教师 张艳 职 称 讲师 所在学院 农学院 论文名称 海岛棉抗黄萎病相关基因GbEDS1的克隆与生物信息学分析 选题依据： 理论依据 本研究根据不同物种的EDS1核酸保守区域设计简并引物，利用RT-PCR和RACE技术从海岛棉克隆抗黄萎病相关基因EDS1的cDNA及开放阅读框序列（Open reading frame，ORF），并利用生物信息学软件分析序列特征特性。 意义 棉花是世界上重要的经济作物，据估计，棉花创造的年产值达1800-2000亿美元，全世界有18亿人口以种植棉花为生[1]。棉花在整个生长过程中都受到病害的威胁，而黄萎病是棉花病害中对生产和产量威胁最大、危害最重的病害。棉花黄萎病（Verticillium wilt）是一种土传真菌性病害，由