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3 讨论 - 水产学报
尼罗罗非鱼、萨罗罗非鱼及其杂交子代胰岛素样生长因子(IGF-Ib)基因3`cDNA末端克隆及序列分析
重新补充作者及单位信息,此次修改后不能作添加等修改
范武江,李思发*,王兵,孟庆辉
(上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室,上海 201306)
摘要:为探讨尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)新吉富品系、萨罗罗非鱼(Sarotherodon melanotheron)及其杂交子代(Oreochromis niloticus♀× Sarotherodon melanotheron♂)IGF-I基因结构差异,研究IGF-I基因与三种基因型罗非鱼耐盐性能差异之间的的关系,通过3`-RACE的方法从鳃的总RNA分别获得其IGF-Ib基因的部分cDNA序列,长度分别为1076bp、1075bp和1079bp,包含完整的开放阅读框(ORF)546bp、一个终止密码及含polyA信号的3`UTR;ORF编码182个氨基酸,包括信号肽(44aa),成熟肽B区(29aa)),萨罗罗非鱼在E133位发生Ala/Pro氨基酸残基替换,与莫桑比克罗非鱼和画眉罗非鱼一致,推测IGF-Ib基因E区选择性剪切与三种罗非鱼耐盐性能差异有关。
关键词:尼罗罗非鱼;萨罗罗非鱼;杂交子代;胰岛素样生长因子–I b;cDNA;克隆
CLONING AND SEQUECNCING OF IGF-Ib 3`cDNA IN OREOCHROMIS NILOTICUS , SAROTHERODON MELANOTHERON AND THEIR HYBRID
Fan Wu-jiang, Li Si-fa,Wang Bing,Meng Qing-hui
Key Laboratory of Aquatic Genetic Resources and Aquacultural Ecosystem Certificated by the Ministry of Agriculture,Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China
补充作者及单位的英文信息
Abstract:Nele tilapia(Oreochromis niloticus NewGifts,ON ), black-chined tilapia(Sarotherodon melanotheron,SM) and their First Generation of Hybrid (HB), investigating the relationships between the great
differences of salt-resistant property among the three genotypes , we cloned partial cDNA fragments of insulin-like growth factor I(IGF-I)from gill extracts through rapid amplification of 3` cDNA ends(3`RACE)methods. The results were demonstrated to be the IGF-Ib gene cDNAs with length of 1076bp,1075bp and 1079bp respectively and comprising of a stop codon, a 546bp open reading frame(ORF) encoding a 182 amino acid peptides(aa), and 3-untranslated regions(3`-UTR). The deduced amino acid sequence of IGF-Ib precursor composed of signal peptide, mature peptide(including conserved B,C,A and D domain consisting of 29-aa,10-aa,21-aa and 8-aa respectively)and E domain of 70aa. Results of the predicted secondary structures of IGF-Ib were typed as “mixed patterns”. The results of multiple alignments showed highly homologous with 75.8% to 100% amino acid identity. The B and A domain
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