定量差异蛋白质组学数据分析处理方法 - abc.PDF

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2017-06-30 发布于天津
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定量差异蛋白质组学数据分析处理方法 - abc.PDF

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定量差异蛋白质组学数据分析处理方法 - abc

2012春ABC课程期末汇报15组定量差异蛋白质组学数据分析处理方法 Data analysis of quantitative differential proteomics 组员：王舒心白雪李泽洋鲍锦涛汇报人：鲍锦涛时间：2012. 06. 11 主要内容 •  蛋白质组学简介 •  定量差异蛋白质组学工作流程 •  定量差异蛋白质组学数据分析蛋白质组学简介组学（Omics）组学指的是一类个体的集合。包括：基因组学（Genomics），转录组学(transcriptomics）蛋白组学（Proteomics），代谢组学（Metabolomics），转录组学脂类组学（lipidomics），免疫组学（Immunomics），糖组学（glycomics ）和 RNA组学(RNomics)等。蛋白质组学简介蛋白质组与蛋白质组学 •  蛋白质组指的是一个细胞，一个组织或一种生物的基因组所表达的全部蛋白质总和。 •  蛋白质组的研究特点：全面性 + 动态性 + 整体性 •  蛋白质组学的研究领域：表达蛋白质组学定量蛋白质组学蛋白质翻译后修饰功能蛋白质组学表达蛋白质组学。。。。。。蛋白质组学简介常用的定量蛋白组学技术 SILAC技术荧光差异电泳技术 SRM技术 iTRAQ标记技术 Label-free 技术工作流程 SILAC定量蛋白质组学工作流程 “Light” “Heavy” 定量精确高效性高灵敏度高通量 /pierce 数据分析 Ø  原始数据初筛 u 筛选出关键数据，清除Contaminant等分析障碍数据分析 Ø  原始数据初筛 u  保留关键条目，如Uniprot AC 等 u  找出两次重复都出现的蛋白（利用Exel VLOOKUP IF函数） u  根据两次重复的平均Ratio值排序删去(0.5,2) OR (0.67,1.5) 对应结果数据分析 Ø  散点图重复性分析数据分析 Ø  散点图重复性分析 1. 2. u  取Ratio值的对数进行相关性分析数据分析 Ø  散点图重