小单孢菌3!，4!双脱羟基酶基因功能的研究-《中国药科大学学报》！.PDF

学 报 ８８ ＪｏｕｒｎａｌｏｆＣｈｉｎａＰｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ　２０１１，４２（１）：８８－９１ 小单孢菌３′，４′双脱羟基酶基因功能的研究 １ １ １ ２ ３ 张国华 ，洪文荣 ，饶以群 ，樊伟明 ，朱宝泉 １ ２ ３ （福州大学生物科学与工程学院，福州３５０１０８；浙江震元制药有限公司，绍兴３１２０００；上海医药工业研究院，上海２０００４０） 摘　要　根据文献查阅、同源比对及进化树分析，推测绛红色小单孢菌中ｇｎｔＩ和伊纽小单孢菌ｓｉｓＩ为３′，４′双脱羟基 酶基因。通过克隆得到ｇｎｔＩ和ｓｉｓＩ，随后将其构建到ｐＥＴ３０ａ表达载体，并在Ｅ．ｃｏｌｉＢＬ２１实现异源表达。利用生物信息学对 该蛋白亲水性图谱、空间结构及活性域进行分析、预测。基于同源建模得到三级结构，推测其二级结构以 螺旋为主，肽段 α ４０～６０，１００～１２０处可能为该酶活性中心。此研究为该酶进一步功能研究和应用奠定了基础。 关键词　小单孢菌；３′，４′双脱羟基酶基因；生物信息学 中图分类号　Ｑ７５３；Ｑ７８４　　文献标识码　Ａ　　文章编号　１０００－５０４８（２０１１）０１－００８８－０４ Ｆｕｎｃｔｉｏｎｏｆ３′牞４′ｄｏｕｂｌｅｄｅｈｙｄｒｏｘｙｌａｓｅｇｅｎｅｆｒｏｍＭｉｃｒｏｍｏｎｏｓｐｏｒａ １ １ １ ２ ３ ＺＨＡＮＧＧｕｏｈｕａ牞ＨＯＮＧＷｅｎｒｏｎｇ 牞ＲＡＯＹｉｑｕｎ牞ＦＡＮＷｅｉｍｉｎｇ牞ＺＨＵＢａｏｑｕａｎ １ ２ ＳｃｈｏｏｌｏｆＢｉｏｌｏｇｉｃａｌＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ牞ＦｕｚｈｏｕＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ牞Ｆｕｚｈｏｕ３５０１０８牷ＺｈｅｊｉａｎｇＺｈｅｎｙｕａｎＰｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌＣｏ．Ｌｔｄ．牞 ３ Ｓｈａｏｘｉｎｇ３１２０００牷ＳｈａｎｇｈａｉＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＰｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌＩｎｄｕｓｔｒｙ牞Ｓｈａｎｇｈａｉ２０００４０牞Ｃｈｉｎａ Ａｂｓｔｒａｃｔ　Ｔｈｒｏｕｇｈｒｅｓｅａｒｃｈｉｎｌｉｔｅｒａｔｕｒｅ牞ｈｏｍｏｌｏｇｏｕｓａｌｉｇｎｍｅｎｔａｎｄｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃａｎａｌｙｓｉｓ牞ｇｎｔＩｆｒｏｍＭｉｃｒｏ ｍｏｎｏｓｐｏｒａｐｕｒｐｕｒｅａａｎｄｓｉｓＩｆｒｏｍＭｉｃｒｏｍｏｎｏｓｐｏｒａｉｎｙｏｅｎｓｉｓｗｅｒｅｐｒｅｓｕｍｅｄｔｏｂｅ３′牞４′ｄｏｕｂｌｅｄｅｈｙｄｒｏｘｙｌａｓｅ ｇｅｎｅ．ＴｈｅｎｔｈｅｎｕｃｌｅｉｃａｃｉｄｓｅｑｕｅｎｃｅｏｆｇｎｔＩａｎｄｓｉｓＩｗｅｒｅａｍｐｌｉｆｉｅｄａｎｄｌｉｇａｔｅｄｔｏｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｖｅｃｔｏｒｐＥＴ３０ｆｏｒ ｈｅｔｅｒｏｌｏｇｏｕｓｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｉｎＥ．ｃｏｌｉＢＬ２１．Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓｗａｓｕｔｉｌｉｚｅｄｔｏａｎａｌｙｚｅｔｈｅｈｙｄｒｏｐａｔｈｙｐｌｏｔ牞ｓｔｒｕｃｔｕｒｅａｎｄ ｃａｔａｌｙｔｉｃｄｏｍａｉｎｏｆｔｈｅｐｒｏｔｅｉｎＧｎｔＩａｎｄｓｉｓＩ．Ｂａｓｅｄｏｎｈｏｍｏｌｏｇｏｕｓｍｏｄｅｌｉｎｇ牞ｔｈｅｓｐａｔｉａｌｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓｗｅｒｅｇａｉｎｅｄ牞 ｓｐｅｃｕｌａｔｉｎｇｔｈａｔｈｅｌｉｘｗａｓｔｈｅｍａｉｎｓｅｃｏｎｄａｒｙｓｔｒｕｃｔｕｒｅ牞ａｎｄｃａｔａｌｙｔｉｃｄｏｍａｉｎｍａｙｂｅｌｏｃａｔｅｄａｔ４０６０牞１００ α １２０ａｍｉｎｏａｃｉｄｓ．Ｔｈｉｓｓｔｕｄｙｅｓｔａｂｌｉｓｈｅｄｔｈｅｆｏｕｎｄａｔｉｏｎｆｏｒｆｕｒｔｈｅｒｆｕｎｃｔｉｏｎａｌｒｅｓｅａｒｃｈａｎｄｐｏｔｅｎｔｉａｌａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｏｆ ３′牞