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EST-SSR标记在白菜种质资源分析中的应用.pdf
固 澎fJ摩J-:矸学 2007年第6期
EST—SSR标记在白菜种质资源分析中的应用
忻 雅 ,张 帆 ,崔海瑞 ,林容杓
(1.浙江大学原子核农业科学研究所,浙江杭州 310029;2.杭州市农业科学研究院,浙江杭州 310024;
3.忠南大学 园艺系,大田 305764,韩国)
摘 要:利用EST-SSR标记对30份白菜种质资源进行分析。结果 EST-SSR标记可以作为白菜品种鉴定、种
质资源评价和亲缘关系进行有效分析。
关键词:白菜;EST-SSR标记;种质资源
中图分类号:$634.024 文献标识码:B 文章编号:0528—9017(2007)06—0628—02
白菜类蔬菜,包括小白菜和大白菜,在我国栽 资源进行了研究和分析,取得一定效果。现将有关
培历史悠久,且地域分布广泛,资源丰富。采用分 结果简要报道如下。
子标记对白菜种质资源进行鉴定和分析,对白菜遗
1 材料与方法
传研究和品种改良具有重要意义。目前,白菜遗传
育种中利用的DNA分子标记主要有 RFLP、RAPD 1.1 供试材料与模板 DNA的提取
和 AFLP,近年来 也建立 了以 EST (Expressed 本研究用30份白菜材料进行种质资源的分析
sequence tag)为基础的标记,如 EST—PCR和 EST— 和鉴定 (表1)。将表 1各材料播种于温室,在4~
SSR 。为此,我frjN用EST—SSR标记对白菜种质 5叶时取幼嫩叶片,采用改良的CTAB法提取DNA。
表1 供试白菜材料及类型
编号 名称 类型 编号 名称 类型 编号 名称 类型
1 白交系A 大白菜 11 油冬儿 小白菜 2l 抗热605 小白菜
2 白交系B 大白菜 l2 上海青 小白菜 22 五月慢 小白菜
3 热优2号 大白菜 l3 苏州青 小白菜 23 10383 大白菜
4 早熟5号 大白菜 l4 高华青梗 小白菜 24 26 大白菜
5 GG1 小白菜 l5 四月蔓 小白菜 25 热优2号青梗 大白菜
6 605 小白菜 l6 香港菜心 小白菜 26 山东4号 大白菜
7 38A 小白菜 l7 京丰 1号 甘蓝 27 蚕白菜 大白菜
8 黄芽l4 小白菜 l8 矮抗青 小白菜 28 长梗白菜 大白菜
9 矮蒲头 小白菜 l9 绿宝2号 小白菜 29 丰抗80 大白菜
l0 红明青 小白菜 20 矮萁青 小白菜 30 丰抗70 大白菜
1.2 EST—SSR扩增与检测 二进制矩阵。所得数据在 NTSYS一1.7软件上按
共设计了l5对EST—SSR引物,由上海生工生 UPGMA进行聚类分析和绘图。绘图过程中使用Nei
物技术公司合成。用这l5对引物分别对上述30份 和 公式计算遗传距离 (GD)。GD计算公式为
材料的DNA进行PCR扩增
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