检测A 组轮状病毒的微阵列技术初探.PDFVIP

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检测A 组轮状病毒的微阵列技术初探

China Biotechnology, 2005, 25(3):79~ 83 A * 1** 1 2,3 1 1 1 1 黄海燕 韩金祥 王健伟 高雪芹 潘继红 刘 毅 朱 波 ( 1 250062 2 250062) (3 100052) 采用荧光染料TAMRA 标记上游引物, 经RTseminested PCR 扩增A 组轮状病毒的保守区 域,并将扩增产物与自行 制的玻片微阵列进行杂交经杂交信号扫描分析, 可简便快速地检出 A 组轮状病毒, 并能达到高灵敏性, 为下步进入临床打下了基础 A 组轮状病毒 微阵列 杂交 TM ( rotavirus,RV), ArrayIt SMP3 (TeleChem ),CL1000 11 RNA 6 ( UVP ) ,AlphaImagerTM2200 (VP1VP2VP3VP4VP6VP7) 5 (Alpha ),ScanArray 4000 [ 1] ( NSP1~ NSP5) (PE ),CSA100 silanated VP6 , RV A~ G 7 slides(Amine) ( CEL ), A RV 5 (Corning) ,HYBRISlips ( , , A Sigma ) [2] RV 873 , 113 主要试剂 Trizol RNA ( 2 ; 2 , Invitrogen ), RNA PCR(AMV) VER 21 50%RV (TaKaRa) , 12 , 121 特异性 物和寡核苷酸探针的设计 , NCBI,EBI,DDBJ A , , Vector NTI Suite80 Alignment , A 1 NSP5 11 Primer Premier50 3 ( PAu1, 111 病毒毒株 Wa(G1),RV5 (G2 ), PAd1, PAd2) 2 (Probe1,Probe2) PAu15! TAMRA , 2 Probe1,Probe2 5! 112 仪 器 PTC200 (MJ linker :TPAu1: ), PCA300 ( BIORAD ), 5!TAMRATCTGGAAAATCTATTGGTAGG3!, pAd1: Centrifuge 5804R ( Eppendorf ), 5!GAATCCATAGACACGCCA3!, pAd2: 5! PixSys5500 ( Cartesian ), CATCATCACTATCTGAATCATC3!, NprobeA1: 5!

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