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检测A 组轮状病毒的微阵列技术初探
China Biotechnology, 2005, 25(3):79~ 83
A *
1** 1 2,3 1 1 1 1
黄海燕 韩金祥 王健伟 高雪芹 潘继红 刘 毅 朱 波
( 1 250062 2 250062)
(3 100052)
采用荧光染料TAMRA 标记上游引物, 经RTseminested PCR 扩增A 组轮状病毒的保守区
域,并将扩增产物与自行 制的玻片微阵列进行杂交经杂交信号扫描分析, 可简便快速地检出
A 组轮状病毒, 并能达到高灵敏性, 为下步进入临床打下了基础
A 组轮状病毒 微阵列 杂交
TM
( rotavirus,RV), ArrayIt SMP3 (TeleChem ),CL1000
11 RNA 6 ( UVP ) ,AlphaImagerTM2200
(VP1VP2VP3VP4VP6VP7) 5 (Alpha ),ScanArray 4000
[ 1]
( NSP1~ NSP5) (PE ),CSA100 silanated
VP6 , RV A~ G 7 slides(Amine) ( CEL ),
A RV 5 (Corning) ,HYBRISlips (
, , A Sigma )
[2]
RV 873 , 113 主要试剂 Trizol RNA (
2 ; 2 , Invitrogen ), RNA PCR(AMV) VER 21
50%RV (TaKaRa)
, 12
, 121 特异性 物和寡核苷酸探针的设计
, NCBI,EBI,DDBJ A
, ,
Vector NTI Suite80 Alignment
, A
1
NSP5
11 Primer Premier50 3 ( PAu1,
111 病毒毒株 Wa(G1),RV5 (G2 ), PAd1, PAd2) 2
(Probe1,Probe2) PAu15!
TAMRA , 2 Probe1,Probe2 5!
112 仪 器 PTC200 (MJ linker :TPAu1:
), PCA300 ( BIORAD ), 5!TAMRATCTGGAAAATCTATTGGTAGG3!, pAd1:
Centrifuge 5804R ( Eppendorf ), 5!GAATCCATAGACACGCCA3!, pAd2: 5!
PixSys5500 ( Cartesian ), CATCATCACTATCTGAATCATC3!, NprobeA1: 5!
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