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分生实验(一).ppt

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分生实验(一)汇编

与DNA分子量标准物(Marker)比较能大概判断未知DNA的分子量 质粒DNA为环状,在酶切彻底的情况下,DNA片段数与酶切位点数目相同 2.质粒DNA的酶切鉴定 取一只1.5mL EP管加入以下试剂: 酶切混合液:15 μL 质粒DNA:5 μL 混匀后,置37 ℃过夜保温,反应结束后4 ℃放置备用。 下次实验:PCR技术及应用 P163 质粒DNA酶切鉴定的原理 Marker 质粒DNA过夜酶切 操作步骤(Methods) 分组:4人/组,每组提取两种质粒(空载及重组质粒) 1.质粒的提取 (1)接种一个单菌落(single colony)于5 mL含相应抗生素的LB培养基中,37℃振荡培养至饱和状态(A600=0.4)或过夜。(教师准备) (2)取1.5 mL离心管一支,加入1.4 mL菌液,13 000 r/min离心1 min去掉上清液。加入150 μL 的溶液Ⅰ,充分混悬细菌,在室温下放置10 min。 (3)加入200 μL新配制的溶液Ⅱ。加盖,颠倒5次使之混匀。冰上放置5 min。 (4)加150 μL预冷的溶液Ⅲ,加盖后颠倒5次混匀,冰上放置15 min。13 000 r/min离心5 min,取400 μL上清液移入另一离心管中。 (5)向上清液中加入等体积苯酚/氯仿,震荡混匀,13 000 r/min离心2 min,300 μL上清液转移至新的离心管中。 (6)向上清液中加入等体积无水乙醇,混匀,室温放置2 min。离心5 min,倒去上清乙醇溶液,将离心管倒扣在吸水纸上,吸干液体。 (7)加入1 mL 70 %乙醇,震荡并离心, 13 000 r/min离心2 min,倒去上清液,晾干,加入20 μL的 TE缓冲液,使 DNA完全溶解,待用。 * * * 左下角处有超级链接到配伍末端 1.每个实验室分4组完成实验设计。(请带教老师帮同学按学号顺序分好组,并在登分册上注明分组情况) 2.每组同学集体讨论,完成实验设计,以PPT的形式上交并在实验课上作汇报。 设计性实验具体内容见实验室粘贴的纸质材料 PPT首页格式如下: 关于实验设计的相关通知 2011级本科生化及分子生物学实验设计 年级、专业、班级: 实验课时间: 实验室: 组别: 组员排名: 报告人: 3.评分标准 (1)根据问题回答的正确性、实验设计的合理性及可行性、汇报的流畅性(每组汇报时间限20分钟)将按要求完成的实验设计成绩分为优(9.5)、良(9)、中(8.5)三等。 如实验设计没能按要求完成,将酌情给低于8.5的成绩。 (2)各组自行将组员按实际贡献大小依次排名,成绩从第一名往后依次递减0.2分,汇报人有0.3的加分。 实验一 质粒提取及酶切鉴定 P158 基因工程(genetic engineering)是指采用人工方法将不同来源的DNA进行重组,并将重组后的DNA引入宿主细胞中进行增殖或表达的过程。 相关基础知识 目的基因 工具酶 载体 基因工程相关物质 质粒 存在于细菌细胞内、染色体外、共价闭合的 小型环状DNA分子(covalent closed circular DNA)。 具有自我复制功能。 带有抗性基因及表型识别等遗传性标记物 经改造后具有多克隆位点。 质粒 (plasmid) 特点 能在宿主细胞内独立自主复制;带有某些遗传信息, 会赋予宿主细胞一些遗传性状 限制性核酸内切酶: ------基因工程的手术刀 是分子生物学研究中的一种工具酶,能识别DNA的特异序列, 并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类内切酶。 如:EcoRⅠ和HindⅢ的识别序列和切口是: ? EcoRⅠ:G↓AATTC ? HindⅢ:A↓AGCTT 概念 与甲基化酶共同构成细菌的限制修饰系统(restriction-modification system),限制外源DNA, 保护自身DNA。 作用 分类 酶结构、作用、识别及切割特异性的不同 分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ,基因工程技术中常用Ⅱ型 Ⅰ型酶具有限制和DNA修饰作用,且识别及切割位点不同(下游100-1000bp) Ⅲ型酶具有限制和DNA修饰作用,识别及切割位点不同(相距较近) (1)识别及切割位点相同 (2)识别序列通常为4~8bp的回文结构; (3)切割可产生两类切口,三种末端。 Ⅱ型限制酶特点 Ⅱ型酶识别序列特点— 回文结构(palindrome) 切口 :平端切口、粘端切口 GGATCC CCTAGG Bam HⅠ GTC CAG G CCTAG GATCC G + GGATCC CCTAGG HindⅡ GTCGAC CAGCTG

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