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规范化分子诊断报告的探讨
崔巍
中国医学科学院北京协和医院
患者信息
姓名、性别、唯一的ID号 08/06/1987
出生日期
种族或地域来源
HLA基因配型
种族信息有助于根据数据库分析结果
地中海贫血基因检测
地域来源有助于分析结果
•题目醒目的基因检测项目
囊性纤维化(CFTR基因)分子遗传学分析
ApoE基因型
•标本信息
标本类型、采集的日期和时间
到达实验室的日期和时间、报告日期和时间
需要时注明标本的状态
如冻存、分离或红细胞已裂解
产前诊断--基因检测
胎儿的标本(如羊膜穿刺标本、绒毛膜标本等)应与其母
亲的标本清晰分开,此类标本不能使用母亲姓名
医生信息
姓名
实验室信息
名称、实验室地址和联系电话
页码信息
每一页均包含页码
一页或多页
当前页码/总页码
多页
每页均有病人唯一标识
如ID号
Page 1/1
附加临床信息
简要描述临床资料 ,说明检测目的
遗传性疾病基因检测
对于家系研究,有足够的信息区分家庭成员的身份
表格或带注释的谱系所提供的信息比文字要重要
尤其适合连锁分析
简要描述临床资料 ,说明检测目的
DMD携带者检测。Nancy DAUTARD 是Jerome DAUTARD (出生日
的母亲。 本实验室最近报告了Jerome DAUTARD 存在
DMD 基因外显子2~4的半合子复制。Nancy DAUTARD 的CK水平正
常
同一个基因有不同名称
同一种变异有不同的表示方式
采用哪一个
发诊断报告?
结果报告
清晰简明、准确、解释、权威
细胞遗传学(如核型、FISH )
采用必威体育精装版版的人类细胞遗传命名系统(ISCN )命名
分子遗传
参考序列和命名应使用必威体育精装版HGVS命名;
人类基因组变异协会
DNA水平vs蛋白水平?
DNA水平变异
可能不会导致蛋白质序列的变化
会影响RNA的稳定性或者激活隐蔽剪切位点
蛋白质水平的变化
经常是由基因序列推测出来
不是实验直接得出的结论
只使用蛋白质水平的变异可能引起错误,举例:
CFTR最常见的突变:p.Phe508del,
c.1521_1523delCTT ?c.1522_1524delTTT ?
优选DNA水平描述 Phe 苯丙氨酸
标准命名VS常用命名
不同数据库版本,基因碱基号码或密码子号码可能不同
当某个非正式命名被广泛采用,报告中可以包含此名称
可用括号将其备注在标准命名的后面
或将常用名称放在报告的诊断部分
而将标准命名放在方法学部分
或在报告中单独加以报告说明
以使分析报告的人更加明确,避免出现理解错误
标准命名 常用命名
基因名 基因水平 蛋白水平
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