15 肿瘤个体化检测室间质量评价及问题分析-张瑞.pdfVIP

肿瘤个体化检测室间质量评价 及问题分析 张 瑞 卫生部临床检验中心 肿瘤个体化检测室间质量评价 EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA突变 EML4-ALK融合基因，HER2扩增 EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA突变 全国EGFR突变室间质量评价 调查：2012年7月-8月 正式室间质评：2014年 全国KRAS突变室间质量评价 调查：2013年7月-8月 正式室间质评：2014年 全国BRAF突变室间质量评价 正式室间质评：2015年 全国PIK3CA突变室间质量评价 调查：2015年1月 正式室间质评：2016年 EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA突变 点突变 缺失 插入 EGFR、KRAS、BRAF参评实验室情况 32 53 37 病理科 检验科 33 独立实验室 其他 2014年和2015年EGFR、KRAS、 2015年EGFR参评实验室分布 BRAF参评实验室数量 其它：研究所、内科实验室、外科实验室、药 剂科实验室、中心实验室、生物免疫治疗中 心……. 样本类型 甲醛固定的石蜡包埋样本，每支样本管中含3张10 μm的石 蜡切片，DNA含量不少于500ng。此样本可在2-8℃长期保 存。 EGFR网络回报表 一、检测范围 EGFR基因 28个外显子 EGFR回报方法学 方法学名称 检测突变范围 18、19、20和21外显子的部分突变，有的不分具体 ARMS-探针法 突变位点 PCR-直接测序 包括18、19、20和21外显子 PCR-焦磷酸测序法 包括18、19、20和21外显子 部分试剂只检测18、19和21上的所有基因突变，以及 HRM EGFR基因外显子20上的T790M位点 ARMS-探针法+19号外显子PCR- 不检测20外显子T790M 2369 CT突变 直接测序 PCR-dHPLC 部分试剂不检测20,18，对19不区分 PNA-探针法 包括18、19、20和21外显子 流式荧光杂交法 包括18、19、20和21外显子 高通量测序 目标区域的突变 检测范围——KRAS突变 KRAS网络回报表 检测范围 由于实验室的情况和预期用途不同，在质 评中，对实验室必须检测该基因的哪些突 变没有规定 ； 但要求实验室选择检测范围，实验室检测 范围的结果必须正确。