同聚DNA分子poly（dA）·poly（dT）主链的振动位移.pdfVIP

第l6卷第6期 激 光 生 物 学 报 V01．16 NO．6 2007年 12月 ACTA LASER BIOLOGY SINICA Dec．2O07 · 基础研究 · 同聚DNA分子poly(dA)·poly(dT) 主链的振动位移 金京林 ，盂耀勇 (华南师范大学a．计算机学院；b．信息光电子科技学院，广东广州510631) 摘 要：基于同聚DNA分子poly(dA)·poly(dq、)的螺旋对称性，利H{晶格动力学方法，计算了DNA分子poly (dA)·poly(drr)主链振动的本征矢，探讨了振动位移矢量和线二色光谱的关系。结果表明，对应着磷酸双氧的 反对称振动谱线 以用于商接确定磷酸根的取向，精度小于1。 其它谱线必须通过对分子的简正分析来帮助 确定分子的结构。 关键词：poly(dA)·lloly(dT)；品恪动力学；线二色光谱 中图分类号：0657．37 文献标识码：A 文章编号：1007—7146(2007)06—0698—04 Displacements of Backbone Vibrational Modes of Poly(dA)·poly(dT) JIN ring—lirl ．MENG Yao—yong (South China Normal University a．School ot。Computer Science：tt．School f0r Intbrmation and Opoeleetronie Scierme and Engineel‘ing，Guangzhou 5 1 063 1，Guangdong，China) Abstract：The displaeelnems of backbone viblational modes of poly(dA)·poly(d rr)were calculated by lattice dy． nanfics．The relationship between the linear dichroism and the vibrational displaeelnent was discussed．The results indi— eated that onlythe lineal dichroism bamls assigned to symmetric dioxy vibrations of PO4 groups can be used to simply de— cide the orientation of PO4．The elT01’is less than 1 degree．The other linear diehroism bands Call be correlated with structure of poly(dA)‘poly(dT)only by nollna]analysis． Key words：poly(dA)·poly(dq、)；lattice dynalnics；linear diehroisln poly(dA)·poly(dT)是指双螺旋链中的一条链 的DNA分子，人们对其结构进行了大量研究。s． 上只包含腺嘌呤(A)而另一条链f 只包含嘞腺嘧啶 Arnott。 根据纤维DNA的x一衍射先后给出了两个 的那种特殊序列的DNA分子。巾于该种DNA分子 结构模型，即改良的B型和异规模型。H．C．Nel— 具有许多独特的结构 物 性质，它在基因转录和 SOIlL 2j和M．Coil 根据DNA分子的单晶衍射给出一 DNA分子在核小体中肜成扭转的三级结构具有重要 种具有强烈的碱基扭转的B型