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奥利亚罗非鱼SOX9基因cDNA全长的克隆及分析.pdf

第l7卷第1期 上 海 水 产 大 学 学 报 Vo1.17.No.1 2008年1月 JOURNAL OF SHANGHAI FISHERIES UNIVERSITY 文章编号:1004—7271(2008)01—0006—06 奥利亚罗非鱼SOX9基因cDNA 全长的克隆及分析 曹丽萍,俞菊华,殷国俊,李建林,丁炜东 (中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,农业部水生动物遗传育种和 养殖生物学重点开放实验室,江苏无锡 214081) 摘 要:SOX9基因是重要的转录调控因子,与性别分化形成密切相关。以奥利亚罗非鱼(Oreochromis aurea) 为研究材料,使用RT—PCR和RACE法分离和克隆了奥利亚罗非鱼卵巢中SOX9基因cDNA的全长序列。序 列全长1 582 bp,其中5’端非翻译区长7l bp,3’端非翻译区长75 bp,开放性阅读框长1 437 bp,编码478个氨 基酸。其中第98位开始共81个氨基酸为HMG保守盒。将奥利亚罗非鱼SOX9基因与虹鳟等八种动物的氨 基酸序列相比较发现,它们同源性达75%左右,表明SOX9基因在进化中较保守。 关键词:奥利亚罗非鱼;SOX9;RT-PCR 中图分类号:s 917 文献标识码:A The cloning and analysis of SOX9 gene derived from Oreochromis aurea CAO Li-ping,YU Ju-hua,YIN Guo-jun,LI Jian-lin,DING Wei-dong (Key Omn Laboratoryfor Genetic Breeding ofAquatic Animals and Aquaculture Biology,Ministry ofAgriculture, Freshwater Fisheries Research Center,Chinese Academy ofFishery Science,Wuxi 214081,China) Abstract:SOX9 gene is one of the important transcription factors involved in developments of many tissues and organs,particularly in sex determination and chondrogenesis.In this paper,RT—PCR and RACE(rapid amplification cDNA ends)methods were used for the isolation of the whole cDNA of SOX9 gene from ovary of Oreochromis aurea.Sequence analysis revealed a 1 582 bp cDNA containing the 71 bp 5’untranslated region, 75bp 3’-untranslated region and 1 437 bp open reading frame encoding 478 amino acids.HMG box of 81.amino acid motif was confirmed to have appeared from the 96th to 176th amino acid site.Sequence alignment exhibited the identity rate of amino acid of SOX9 among eight kinds of animals including Tetraodon with more than 75%.The result indicated the SOX9 gene is relatively conservative in the

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