基于k mer组я信息的系统发生树构建方法 - 生物信息学.PDF

１１ ２ Ｖｏｌ．１１Ｎｏ．２ ２０１３ ６ 　　　　　　　　　　ＣｈｉｎｅｓｅＪｏｕｒｎａｌｏｆＢｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ Ｊｕｎ．，２０１３ ｄｏｉ：１０３９６９／ｊ．ｉｓｓｎ．１６７２－５５６５．２０１３．０２．０４ ｋｍｅｒ １ ２，３ ， （１． ， ０１６０００；２． ， ０１４０１０； ３． ， ０１４０１０） 　 ： ， 。 。 －ＤＮＡ ｋｍｅｒ 。 ｋ ｍｅｒ 。 ｋｍｅｒ ， ， ， ８４ ， 。 ： ；ｋｍｅｒ ； ：Ｑ６１　　 ：Ａ　　 ：１６７２－５５６５（２０１３）－０２－１００－０５ Ａｍｅｔｈｏｄｆｏｒｃｏｎｓｔｒｕｃｔｉｎｇｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｔｒｅｅｂａｓｅｄｏｎｋｍｅｒｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ １ ２，３ ＬＩＵＨｏｎｇｍｅｉ，ＬＩＵＧｕｏｑｉｎｇ （１．Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆｒｅｓｐｉｒａｔｉｏｎ，Ｐｅｏｐｌｅ’ｓＨｏｓｐｉｔａｌ，Ｗｕｈａｉ０１６０００，Ｃｈｉｎａ；２．ＳｃｈｏｏｌｏｆＭａｔｈｅｍａｔｉｃｓ，Ｐｈｙｓｉｃｓ ａｎｄＢｉｏｌｏｇｉｃａｌＥｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，ＩｎｎｅｒＭｏｎｇｏｌｉａＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｂａｏｔｏｕ０１４０１０，Ｃｈｉｎａ；３．ＴｈｅＩｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆＢｉｏｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，ＩｎｎｅｒＭｏｎｇｏｌｉａＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｂａｏｔｏｕ０１４０１０，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｗｉｔｈｔｈｅｓｕｃｃｅｓｓｉｎｔｈｅｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇｏｆｃｏｍｐｌｅｔｅｇｅｎｏｍｅｓ，ｔｈｅｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｓａｎａｌｙｓｉｓｂｙａｌｉｇｎｍｅｎｔｆｒｅｅ ｍｅｔｈｏｄｓｂａｓｅｄｏｎｃｏｍｐｌｅｔｅｇｅｎｏｍｅｓｈａｓｂｅｅｎａｈｏｔｔｏｐｉｃ．Ｔｈｅｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎｉｓｄｉｆｆｅｒｅｎｔａｃｒｏｓｓｓｐｅｃｉｅｓｏ