李ran 基因的克隆与生物信息学分析cloning and - 天恩泽.pdf

分子植物育种，2014 年，第12 卷，第4 期，第780-787 页 Molecular Plant Breeding, 2014, Vol.12, No.4, 780-787 研究报告 Research Report 李Ran 基因的克隆与生物信息学分析 方智振 周丹蓉 姜翠翠 廖汝玉 叶新福* 福建省农业科学院果树研究所, 福州, 350013 * 通讯作者, yexinfu@126.com 摘 要 本研究以芙蓉李为材料，采用同源克隆和RACE 技术从芙蓉李叶片中分离得到2 个李Ran 基因 和 ，长度分别为984 bp 和952 bp。生物信息学分析结果表明， 和 均编码221 PsRan1 PsRan3 PsRan1 PsRan3 个氨基酸。PsRan1 和PsRan3 与其他物种的Ran 蛋白具有很高的相似性，均具有Ran 蛋白的特征结构域，包 括与GTP 结合与水解有关的结构域、C-末端酸性结构域和影响因子结合结构域。NetPhos 2.0 Server 预测结 果表明二者具有10 个相同的磷酸化位点。 关键词 李, Ran, 基因克隆, 生物信息学 Cloning and Bioinformatic Analysis of Ran Genes from Prunus salicina Lindl. Fang Zhizhen Zhou Danrong Jiang Cuicui Liao Ruyu Ye Xinfu * Fruit Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fuzhou, 350013 * Corresponding author, yexinfu@126.com DOI: 10.13271/j.mpb.012.000780 Abstract Using Furong plum as experimental material, 2 PsRan genes, PsRan1 and PsRan3, were isolated through homologous cloning and RACE technology. PsRan1 and PsRan3 contained 984 bp and 952 bp in length respectively. Sequence analysis indicated that both PsRan1 and PsRan3 encode 221 amino acids. PsRan1 and PsRan3 showed high similarity with Ran proteins from other plants and contained characteristic domains of Ran proteins, including domains involved in GTP-binding and hydrolysis, as well as the acidic C-terminal domain and the effector-binding domain. Prediction of phosphorylation sites in these peptides using the NetPhos 2.0 server showed both of these PsRan proteins contained 10 identical phosphorylation sites. Keywords Plum, Ran, Gene cloning, Bioinformatics Ran (Ras-like nuclear GTPase) 是一类在真核生 列上高度同源(Zang et al., 2010; Lü et al., 2011) ，且超 物中高度保守的小GTP 水解酶，在核质运输、纺锤 表达植物Ran 可使细胞周期缺陷型酵母突变体正常 体和核膜形成等细胞过程中扮演着重要角色(Hetzer 生长(Wang et al., 2004)。以上研究结果表明，