刘波博士 - yzxzcom.ppt

一、立项依据 二、拟解决的关键问题 三、研究思路 四、预期目标 五、研究进展-（4）高效菌株功能基因分析和应用技术研究 短短芽胞杆菌FJAT-0809-GLX的基因组草图 短短芽胞杆菌FJAT-0809-GLX： 基因组规模为6 Mb，预测得到5666个基因，平均长度为933bp，基因密度达到87.83%，基因组的GC含量为47.30%； 核糖体rRNA因为是重复序列，拼接和预测不完整，tRNA预测得到80个； 与短短芽胞杆菌NBR100599相比较，FJAT-0809-GLX有177个菌株特异基因 文章与专利 专利： 一种新的短短芽孢杆菌菌株及其应用，申请号：201010296437.6，2012年2月发授权证书。 一种提取Bt杀虫蛋白晶体的方法，专利申请受理号：201110408518.5。 软件著作权： 磷脂脂肪酸土壤微生物群落分析软件，登记号：2011S094236。（已授权） 文章： 刘国红, 林营志, 林乃铨, 刘波. 芽胞杆菌分类研究进展. 福建农业学报, 2011, 26 (5): 911-917. 林营志, 刘国红, 刘波, 肖荣凤，刘波. 香蕉枯萎病芽胞杆菌生防菌的筛选及其抑菌特性研究. 福建农业学报, 2011, 12. 张彦，车建美，刘波*，唐乐尘. 蜡样芽胞杆菌ANTI-8098A在番茄内的定殖和对青枯病的防治研究. 中国生物防治学报，2011，27（2）：221-227. 车建美，郑雪芳，林抗美，刘波*. 保鲜功能微生物对不同鲜切水果保鲜效果的研究. 福建农业学报，2011, 26（2）：260-264. 刘国红, 林营志, 林乃铨, 刘波*. 芽胞杆菌种类分子鉴定与脂肪酸鉴定方法的比较. 福建农业学报（已投稿）. 刘国红，林营志，刘波*. 芽胞杆菌菌体浓度的快速检测方法.中国农学通报（已投稿）. 王子旋，刘波*，林营志，刘国红. 新疆4个地点土壤芽胞杆菌采集鉴定及其分布多样性.福建农业学报（已投稿）. 陈 峥，刘波*，朱育菁, 胡桂萍, 车建美, 唐建阳. pH条件对短短芽孢杆菌FJAT-0809-GLX次生代谢物产生的影响. 福建农业学报（已投稿）. 我们的团队 结束语 谢谢 Fujian Academy of Agricultural Sciences 芽胞杆菌种质资源多样性及其生态保护功能基础研究 主持人：刘波博士、研究员 参加人员：邱思鑫博士、朱育菁博士、林营志博士、蓝江林博士、阮传清博士、车建美博士、郑雪芳博士生、刘国红博士生 973计划前期研究专项 福建省农业科学院 Fujian Academy of Agricultural Sciences 汇报提纲 一、立项依据 二、关键问题 三、研究思路 四、预期目标 四、研究进展 五、合作成果与知识产权 六、经济效益与社会效益 七、经费来源与项目概算 一、立项依据 芽胞杆菌属（Bacillus） 产芽胞 细胞杆状 革兰氏阳性细菌 好氧或兼性厌氧生活 具有强抗逆性球形或椭圆形芽胞 目前90%以上的活菌制剂都是芽胞杆菌制剂 扫描电镜 菌落 透射电镜 芽胞形成 绿色农业 农药、肥料 兽药、污染 加工、保鲜 植物 动物 产品 芽胞杆菌 生物肥药 生物农药 植物疫苗 生物兽药 生物制品 生物保鲜 芽胞杆菌在绿色农业中的应用 芽胞杆菌的分类方法 经典分类(表型特征） 分子分类法：G+C mol%、DNA重组试验、DNA-DNA杂交、PCR技术、16S rDNA序列测序 化学分类法：脂肪酸甲酯(Fatty Acid Methyl Ester，FAME)谱图分析方法 二、拟解决的关键问题 1. 芽胞杆菌系统发育进化与的资源快速准确鉴定 使芽胞杆菌的系统发育进化明晰化，促进芽胞杆菌资源的整理与利用。 2. 芽胞杆菌资源的多态性与生态环境的关系 通过分析不同生态环境中的芽胞杆菌资源的多态性，探讨资源与环境协同进化的问题，为芽胞杆菌资源的收集与利用研究提供理论指导。 3. 芽胞杆菌资源的功能多样性与基因挖掘 探讨菌株的功能多样性与系统进化的关系，明确系统进化速率与生理功能多样性的关系，促进新基因的挖掘。 4. 芽胞杆菌种内和种属间的基因组改组选育多功能菌株 探索基因组改组技术在芽胞杆菌种内和种属间进行基因聚合与分子改造的关鍵技术与条件，促进多功能菌株资源的选育与高效利用。 特色菌株的全基因组改组 全基因组序列分析 菌株功能 基因分析 信息资源库 在线比对分析系统 功能进化 特色菌株功能 芽胞杆菌系统学及 快速鉴定系统 不同生态环境 采集各种样本 芽胞杆菌选择性 分离与资源的收集 芽胞杆菌标准菌株和 已鉴定菌株 芽胞杆菌 种质资源库构建 明确芽胞杆菌的系统发育进化，并在系统学研究的基础上建立芽胞杆菌快速鉴定