pepfinder 软件对单克隆抗体进行肽图分析 - thermo fisher scientific.pdf

档 文 用 应 PepFinder 软件对单克隆抗体进行肽图分析 1 4 1 0 1 2 张晓夕 , Sutton, Jennifer N. 2 1 赛默飞世尔科技（中国）有限公司 2 v 2 Thermo Fisher Scientific, West Palm Beach, FL, USA 2 1 前言 2.2 PepFinder2.0 新增功能 在PepFinder 软件的2.0 版本中，加入了De Novo （从头 在蛋白质药物产品的质控要求中，肽图分析是其中重要的 测序，指对于没有蛋白序列的物种，根据质谱碎片信息利用 一环。肽图分析包括对蛋白氨基酸序列进行确证及相关修饰的 生物信息学计算，对序列重新拼接和组装，以得到蛋白序列 鉴定和定量。根据蛋白药物质谱分析特点和生物制药应用的特 的技术）功能，可对所有肽段进行De Novo Sequencing （图 殊需求，Thermo Fisher 与Amgen 联合开发了PepFinderTM 软 4 ），或单独对某一张MS/MS 谱图对应的肽段进行De Novo 件。 Sequencing （图5 ）。 PepFinder 不仅具有最基本的肽段序列确证、覆盖率分析、 在PepFinder2.0 软件中，新增了 mgf 格式文件输出功能， 修饰位点鉴定与定量、二硫键分析、图谱对比和肽段CID/ 供MASCOT 用户进行HCP 分析；还新增了Pinpoint txt 文件 HCD/ETD 谱图解析等功能，还具有其独特功能，如未知修饰 输出功能，供Pinpoint 用户进行蛋白绝对定量；方便生物制药 [1-5] 有哪些信誉好的足球投注网站功能和氨基酸突变有哪些信誉好的足球投注网站功能 。这两项功能可以帮助分