its2二级结构系统发育信息在茄属药用植物dna - 中国中药杂志.pdf

２０１７年２月 第４２卷第３期 Ｖｏｌ４２，Ｎｏ３ Ｆｅｂｒｕａｒｙ，２０１７ ·分子生药学 · ＩＴＳ２二级结构系统发育信息在茄属药用植物 ＤＮＡ条形码鉴定中的应用价值 １ １ １ １ １ １，２ 杨烁 ，薛渊元 ，李美慧 ，赵奉熙 ，赵宏 ，张伟 （１山东大学（威海）海洋学院，山东威海２６４２０９； ２中国中医科学院 中药资源中心，北京 １００７００） ［摘要］　ＩＴＳ２是中药鉴定的核心ＤＮＡ条形码之一，基于ＩＴＳ２的中药鉴定方法已被纳入《中国药典》，但分辨力不足仍是制约 其推广应用的主要因素，因此需要进一步挖掘其有助于中药鉴定的遗传信息。在细胞内，ＩＴＳ２以二级结构形式发挥功能，这 种结构所蕴含的丰富遗传信息是核酸序列所无法体现的。该研究以茄属Ｓｏｌａｎｕｍ２６个物种的４０个样本为研究对象来探究 ＩＴＳ２二级结构在茄属药用植物鉴定中的价值。作者利用ＰｉｃＸＡＡＲ，ＭＡＳＴＲ和ＬｏｃＡＲＮＡ软件来比对二级结构，利用ＲＮＡｓｔａｔ 软件将二级结构信息转为系统发育信息，最后利用最大简约法进行建树分析。研究结果表明将ＩＴＳ２二级结构转化为系统发 育信息后信息位点增加了８８５７％，物种关系树上５０％，７５％，９０％以上支持率的支系分别增加了１９０５％，６６６７％，６６６７％， 从而很好地解决了茄属几种药用植物的鉴定问题。鉴于以上结果，作者建议将ＩＴＳ２二级结构信息作为系统发育信息的有益 补充加入到目前ＤＮＡ条形码分析中。 ［关键词］　ＤＮＡ条形码；ＩＴＳ２二级结构；药用植物；茄属 ＡｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｏｆｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎｏｆＩＴＳ２ｓｅｃｏｎｄａｒｙｓｔｒｕｃｔｕｒｅｉｎ ＤＮＡｂａｒｃｏｄｉｎｇｏｆＳｏｌａｎｕｍｍｅｄｉｃｉｎａｌｐｌａｎｔ １ １ １ １ １ １，２ ＹＡＮＧＳｈｕｏ，ＸＵＥＹｕａｎｙｕａｎ，ＬＩＭｅｉｈｕｉ，ＺＨＡＯＦｅｎｇｘｉ，ＺＨＡＯＨｏｎｇ ，ＺＨＡＮＧＷｅｉ （１ＭａｒｉｎｅＣｏｌｌｅｇｅ，ＳｈａｎｄｏｎｇＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙａｔＷｅｉｈａｉ，Ｗｅｉｈａｉ２６４２０９，Ｃｈｉｎａ； ２ＮａｔｉｏｎａｌＲｅｓｏｕｒｃｅＣｅｎｔｅｒｆｏｒＣｈｉｎｅｓｅＭａｔｅｒｉａＭｅｄｉｃａ，ＣｈｉｎａＡｃａｄｅｍｙｏｆＣｈｉｎｅｓｅＭｅｄｉｃａｌＳｃｉｅｎｃｅｓ，Ｂｅｉｊｉｎｇ１００７００，Ｃｈｉｎａ） ［Ａｂｓｔｒａｃｔ］　Ｉｎｔｅｒｎａｌｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｓｐａｃｅｒ２（ＩＴＳ２）ｉｓｏｎｅｏｆｔｈｅｂｒｏａｄｌｙｕｓｅｄｓｔａｎｄａｒｄｃｏｒｅｂａｒｃｏｄｅｓａｎｄａｌｓｏｔｈｅｏｎｌｙｎｕｃｌｅａｒｂａｒｃｏｄｅ ｉｎｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎｏｆＣｈｉｎｅｓｅｔｒａｄｉｔｉｏｎａｌｍｅｄｉｃｉｎｅＡｌｔｈｏｕｇｈｔｈｅＤＮＡｂａｒｃｏｄｅｍｅｔｈｏｄｂａｓｅｄｏｎＩＴＳ２ｉｓｐｏｐｕｌａｒａｎｄｈａｓｂｅｅｎｕｓｅｄｉｎ ＣｈｉｎｅｓｅＰｈａｒｍａｃｏｐｏｅｉａ，ｉｔｓｌｏｗｄｉｓｃｒｉｍｉｎａｔｏｒｙｅｆｆｉｃｉｅｎｃｙｉｓｓｔｉｌｌａｐｒｏｂｌｅｍｔｏｉｔｓｅｘｔｅｎｓｉｖｅａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎＴｈｅｒｅｆｏｒｅ，ｆｕｒｔｈｅｒｓｔｕｄｙｉｓｓｔｉｌｌ ｎｅｃｅｓｓａｒｙｔｏｅｘｐｌｏｒｅｉｔｓｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎｆｏｒｍｅｄｉｃｉｎａｌｐｌａｎｔｓｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎＩｎｃｅｌｌｓ，ＩＴＳ２ａｃｔｉｖｉｔｙｉｓｂａｓｅｄｏｎｉｔｓｓｅｃｏｎｄａｒｙ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅＴｈｅｓｅｃｏｎｄａｒｙｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓａｒｅｐａｒｔｉｃｕｌａｒｌｙｕｓｅｆｕｌｉｎｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃａｎａｌｙｓｉｓｂｅｃａｕｓｅｔｈｅｙｉｎｃｌｕｄｅｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎｎｏｔｆｏｕｎｄｉｎｔｈｅ ｐｒｉｍａｒｙｓｅｑｕｅｎｃｅＩｎｔｈｉｓｓｔｕｄ