itm活性转座子及其结构特征分析 - 中国细胞生物学学报.pdf

网络出版时间：2016-01-13 14:09:04 网络出版地址：/kcms/detail/31.2035.Q1409.002.html 中国细胞生物学学报 Chinese Journal of Cell Biology 2016, 38(1): DOI: 10.11844/cj cb.2016.01.0282 ITm 活性转座子及其结构特征分析 潘春芳 汤定钦 周明兵* (浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地, 临安311300) 摘要 ITm超家族是真核生物基因组中分布最广泛的DNA转座子家族之一, 它们以DNA为 “ ” ITm 媒介, 通过 剪切– 粘贴 机制在基因组中不断跳跃, 引起基因组的重组与突变。随着对 转座子 ITm 的深入研究, 许多 转座子逐渐成为基因克隆、基因表达及其功能研究的重要工具。该文对 ITm 活性 转座子作了较为全面的研究, 并对其结构、拷贝数、分布以及转座特性进行了系统归 ITm 纳, 分析了活性 转座子螺旋–转角– 螺旋(helix-turn-helix, HTH)结构, 天冬氨酸– 天冬氨酸– 天 冬氨酸/谷氨酸(Asp-Asp-Asp/Glu, DDD/E)催化结构域、Linker 、核定位信号(nuclear localization sequence, NLS)及末端反向重复序列(terminal inverted repeats, TIRs) 的序列特征。结果表明, 自 ITm 主转座活性的 转座子必须具备完整的转座酶及TIRs, 上述结构及序列的突变均会不同程度的 ITm 对转座子活性产生影响。这为活性 转座子的鉴定及功能分析奠定了重要基础, 同时, 也为人 ITm 工调控 转座子转座活性提供了理论依据。 关键词 ITm转座子; 转座; HTH结构域; DDD/E催化结构域; 末端反向重复序列 ITm Active Transposons and Analysis of Its Structural Characteristics Pan Chunfang, Tang Dingqin, Zhou Mingbing* (The Nurturing Station for the State Key Laboratory of Subtropical Sil-viculture, Zhejiang A F University, Lin’an 311300, China) Abstract The ITm transposons superfamily is one of the most widespread transposons in eukaryotic organisms among DNA transposons. They jump in the