华北大黑鳃金龟气味结合蛋白犎狅犫犾犗犅犘2 的生物信息 - 植物保护.pdf

　 犘犾犪狀狋犘狉狅狋犲犮狋犻狅狀 华北大黑鳃金龟气味结合蛋白犎狅犫犾犗犅犘２ 的生物信息学分析 庄绪静， 尹 姣， 李克斌， 曹雅忠 　 　 　 　 （中国农业科学院植物保护研究所，北京 １００１９３） 　 摘要 探讨应用生物信息学技术预测华北大黑鳃金龟触角气味结合蛋白ＨｏｂｌＯＢＰ２三维结构及其与苯甲酸己酯的 　 结合模式。利用生物信息学相关工具和网站预测 ＨｏｂｌＯＢＰ２的基本性质，并对其三维结构进行同源建模后发现 的三维结构具有与昆虫普通气味结合蛋白结构的共同特点，即 个 螺旋，其中除了 在外的 个 螺 ＨｏｂｌＯＢＰ２ ６ ２ ５ α α α 旋形成疏水结合口袋，对二硫键起着稳定蛋白结构的作用。将苯甲酸己酯分子对接到 的活性区域，预 ３ ＨｏｂｌＯＢＰ２ 测蛋白质与气味分子的结合模式，经分析可知蛋白质与气味分子主要通过范德华力和疏水作用相互影响，蛋白内部 形成分子内氢键，根据蛋白与气味分子间的结合特性推测ＨｏｂｌＯＢＰ２与气味分子结合的三个关键结合位点分别为： ， 和 。 ＬＥＵ７３ＴＨＲ５４ ＶＡＬ１３７ 关键词 气味结合蛋白； 生物信息学； 同源建模； 分子对接 　 　 　 　 中图分类号： 文献标识码： ： ／ Ｓ４３３．８ Ａ 犇犗犐 １０．３９６９．ｉｓｓｎ．０５２９ １５４２．２０１３．０１．００９ 　 　　 　 　　 　 ｊ 犅犻狅犻狀犳狅狉犿犪狋犻犮狊犪狀犪犾狊犻狊狅犳狋犺犲狅犱狅狉犪狀狋犫犻狀犱犻狀 狉狅狋犲犻狀 狔 犵狆 犎狅犫犾犗犅犘２犻狀狅犾犳犪犮狋狅狉狊犲狀狊犻犾犾犪狅犳狋犺犲 狔 狊犮犪狉犪犫犫犲犲狋犾犲犎狅犾狅狋狉犻犮犺犻犪狅犫犾犻狋犪 ， ， ， 犣犺狌犪狀 犡狌犻狀 犢犻狀犑犻犪狅 犔犻犓犲犫犻狀 犆犪狅犢犪狕犺狅狀 犵 犼犵　 　 　 犵 （ ， ， ， ） 犐狀狊狋犻狋狌狋犲狅犘犾犪狀狋犘狉狅狋犲犮狋犻狅狀 犆犺犻狀犲狊犲犃犮犪犱犲犿 狅犃狉犻犮狌犾狋狌狉犪犾犛犮犻犲狀犮犲狊 犅犲犻犻狀 １００１９３ 犆犺犻狀犪 犳 狔犳 犵 犼犵 犃犫狊狋狉犪犮狋 犜犺犻狊狊狋狌犱 狑犪狊犪犻犿犲犱狋狅 狉犲犱犻犮狋狋犺犲３犇狊狋狉狌犮狋狌狉犲犪狀犱犫犻狀犱犻狀犿狅犱犲狅犳狋犺犲狅犱狅狉犪狀狋犫犻狀犱犻狀 狉狅狋犲犻狀