树鼩干扰素家族的基本构成及分子特征分析.pdf

动 物 学 研 究 2012，Feb. 33(1): 67−74 CN 53-1040/Q ISSN 0254-5853 Zoological Research DOI ：10.3724/SP.J.1141.2012.01067 树鼩干扰素家族的基本构成及分子特征分析 1,2 1,3 4,5 1 4,5 1,* 李明利 , 田巍威 , 高跃东 , 郭 彦 , 黄京飞 , 张华堂 (1. 中国科学院昆明动物研究所 动物模型与人类疾病机理重点实验室, 云南 昆明 650223; 2. 中国科学院研究生院, 北京 100049; 3. 西南大学 生物技术学院, 重庆 北碚 400715; 4. 中国科学院昆明生物多样性大型仪器区域中心, 云南 昆明 650223; 5. 中国科学院昆明动物研究所 遗传资源与进化国家重点实验室, 云南 昆明 650223) 摘要：干扰素(IFN)是在“危险信号”刺激下, 由细胞分泌的具有抗病毒、抗肿瘤、抑制细胞增殖和免疫调节 等多重作用的糖蛋白家族, 在机体免疫系统中具有重要地位。树鼩作为多种人类疾病研究模型的前景已受到广泛 关注, 但对其 IFN 家族的研究尚属空白。该研究在现有的树鼩全基因组数据基础上, 应用大片段核酸序列比对、 基因预测等方法, 对树鼩 IFN 家族的基本构成和分子特征进行预测和分析。结果显示, 树鼩具有 I 型 IFN ：α (5 个 亚型) 、β、ω、κ、ε、δ；II 型 IFN-γ；III 型 IFN ：IFN-λ1、λ2/3, 所编码的氨基酸序列及蛋白空间结构与其它哺乳 动物具有较高的相似性, 但在半胱氨酸位置和 N 糖基化个数上具有部分差异。该研究以全基因组数据对树鼩 IFN 家族信息进行系统挖掘和分析, 为树鼩 IFN 的基因克隆以及其在感染免疫学中的作用和机理研究奠定了基础。 关键词：树鼩; 干扰素; 大片段核酸序列比对; 基因预测 中图分类号：Q959.832; Q951.3; Q347 文献标志码：A 文章编号：0254-5853-(2012)01-0067-08 Genome-wide prediction of interferon family members of tree shrew and their molecular characteristics analysis 1,2 1,3 4,5 1 LI Ming-Li , TIAN Wei-Wei , GAO Yue-Dong , GUO Yan , HUANG Jing-Fei4,5, ZHANG Hua-Tang1,* (1. Key Laboratory of Animal Models and Human D