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斑节对虾泛素融合蛋白ubl40 基因的克隆及表达分析.pdf

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斑节对虾泛素融合蛋白ubl40 基因的克隆及表达分析

广东农业科学… … … … … … … ……2016,43(4):144-150 Guangdong…Agricultural…Sciences………………………………………………………………………………………………………………………………………………………… doi:10.16768/j.issn.1004-874X.2016.04.027 傅明骏,吴松,唐蕾,等.…斑节对虾泛素融合蛋白UbL40基因的克隆及表达分析[J].广东农业科学,2016,43(4):144-150. 斑节对虾泛素融合蛋白UbL40基因 的克隆及表达分析 1,2 1,3 1,4 1 1 1 傅明骏 ,吴  松 ,唐  蕾 ,周发林,邱丽华,江世贵 (1.中国水产科学研究院南海水产研究所/农业部南海渔业资源开发利用重点实验室,广东…广州………510300; 2.…中国水产科学研究院南海水产研究所热带水产研究开发中心,海南…三亚………572028; 3.上海海洋大学水产与生命学院,上海………201306;4.华南农业大学动物科学学院,广东…广州………510642) 摘  要:从斑节对虾( )肝胰腺转录组数据中筛选获得泛素融合蛋白 40基因 Penaeus monodon UbL (ubiquitin/ribosomal…L40…fusion…protein, 40)的部分序列,利用RACE技术克隆其cDNA全长序列,通过 PmUbL 生物信息学进行结构分析;利用实时定量PCR技术检测该基因在斑节对虾不同组织及卵巢不同发育期的表达 情况。结果表明, 40基因cDNA全长571…bp,开放阅读框(Open…reading…frame,ORF)长390…bp,编码 PmUbL 129个氨基酸,预测分子量约14.7…ku,理论等电点为9.76。预测氨基酸序列的N-末端(1~76aa)为高度保守 的泛素结构域,C-末端(77~129aa)为典型的核糖体蛋白L40结构域。多重序列比对表明不同物种的 40 UbL 在进化过程中高度保守。实时定量PCR结果显示PmUbL40基因在肝胰腺的表达量最高,肌肉、卵巢次之,其 他组织的表达较低;在卵巢发育过程中PmUbL40基因在II期表达最高,其次是V期,显著高于I、III、IV期。 研究结果表明PmUbL40基因在斑节对虾卵巢发育过程中可能具有重要作用。 关键词:斑节对虾;泛素融合蛋白L40;卵巢发育;基因克隆 中图分类号:S917;Q786……………………………………………文献标识码:A…………………………………………文章编号:1004-874X(2016)04-0144-07 Molecular characterization and expression profiles of  27 UbS  gene from black tiger shrimp ( )

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